Кроме невольничьих кораблей ВИК и других судов, совершавших плавания к Гвинейскому побережью, Компания, как и частные фирмы, регулярно отправляла в Гайану и на Карибы, особенно в Кюрасао, крупнотоннажные корабли с грузом тканей, бренди и других европейских товаров. Большая часть этих товаров предназначалась не для нидерландских колоний, а для накопления на складах Виллемстада (на Кюрасао. — Прим. ред.), обладавшего одной из самых безопасных и больших гаваней в непосредственной близости от испанских колоний на американском материке, с целью последующей редистрибуции по всем областям Карибского моря, и особенно в Венесуэлу, Новую Гранаду (Колумбию), Пуэрто-Рико, СантоДоминго, Сан-Томас и английские колонии, в том числе североамериканские. Хотя по английским законам такая торговля была нелегальной, много кораблей совершали плавания на Кюрасао из Нью-Йорка, Бостона и Филадельфии с грузом муки, засоленной свинины и другого продовольствия (которое было в дефиците на островах Кюрасао), увозя обратно нидерландские пряности и товары мануфактурного производства в английскую Северную Америку. Таким образом, одной из главных шестеренок в механизме коммерческой империи в западном полушарии был флот барков и шлюпов, многие из которых принадлежали еврейским владельцам, базировавшийся в Кюрасао, который развозил грузы в бассейне Карибского моря, возвращаясь в Виллемстад с грузом венесуэльского какао, красителей, сахара, индиго и серебра. Во время своего наивысшего расцвета в 1680-х и 1690-х г. базировавшийся в Кюрасао флот состоял примерно из 80 барков, каждой из которых управляли от 15 до 80 человек.

«Kleine vaart» (местная торговля) на Карибах велась на частных судах, управляемых моряками, которые жили в Кюрасао. «Grote vaart», трансатлантическая торговля, велась и на кораблях ВИК, и на крупнотоннажных частных судах, плативших пошлины и налоги Компании. Также, в отличие от ОИК, корабли ВИК перевозили товары не для самой Компании, но от имени частных купцов, которые резервировали место для своих товаров через брокеров. С 1707 г. торговля между Амстердамом и Кюрасао была отчасти организована в виде системы конвоев, сопровождаемых военными кораблями. На Кюрасао в конце XVII в. и начале XVIII в. главными факторами были протестанты, зачастую немцы, но большинство средних и мелких торговцев в Виллемстаде были евреями-сефардами, обычно тесно связанными с семьями в Амстердаме и Суринаме.

В течение XVIII в. Синт-Эстатиус также получил большое значение в качестве общего склада и для Карибского бассейна, и для Северной Америки. Начиная приблизительно с 1720 г. сюда приходило большое количество кораблей, чтобы забрать колониальные продукты, предназначавшиеся для европейского рынка, и выгрузить товары, привезенные из Соединенных Провинций. Но в отличие от Кюрасао, который использовал главным образом свой собственный флот, Синт-Эстатиус был, в сущности, удобной перевалочной базой, и большинство кораблей, останавливавшихся в его гавани, было французскими, английскими, испанскими, американскими и нидерландскими, а не местными судами с Нидерландских Наветренных островов. В 1773 г., например, из 146 кораблей, бросивших якорь в гавани Синт-Эстатиуса, 1/3 пришла из французских колоний Мартиника и Гваделупа, и существенную часть составляли американские корабли из Новой Англии и Средних колоний (Средние колонии (англ. «Middle Colonies») — четыре колонии, расположенные между Новой Англией и т. наз. «Южными колониями» — Нью-Джерси, Пенсильвания, Нью-Йорк и Делавэр. — Прим. пер.). Во время великих войн XVIII в. между Францией и Британией Синт-Эстатиус был одной из основных лазеек, через которые французская колониальная продукция продолжала поступать на европейский рынок.

Другим основным направлением нидерландской трансатлантической коммерции была торговля между Республикой и Суринамом (и западной Гайаной), землями сахарных и — после 1700 г. — кофейных плантаций. Они в огромном количестве экспортировали свой сахар и кофе в Голландию и Зеландию, импортируя европейские товары только из Республики, и, до утраты ВИК своей монополии на нидерландскую работорговлю в 1730 г., официально получали рабов только через ВИК. С постепенным увеличением продукции сахара и кофе количество судов, ходивших из этих колоний в Амстердам, возросло до более чем 20 в год после 1720 г. и свыше 40 в год, когда эти колонии достигли апогея своего развития, между 1740 и 1780-ми гг., сделав маршрут Амстердам-Суринам одним из самых важных в нидерландской навигации на дальние расстояния XVIII в.

Подвергаясь давлению со стороны частных купцов, Штаты Голландии и Зеландии и Генеральные Штаты к 1730 г. были вынуждены пойти на отмену монополии на работорговлю, рассчитывая этими мерами увеличить поток рабов в нидерландские колонии, сбить цены на них и сделать нидерландские плантации более конкурентоспособными по сравнению с французскими и английскими плантациями. Отныне нидерландские купцы — преимущественно зеландцы, специализировавшиеся на этой торговле — были обязаны только платить ВИК за разрешение на покупку рабов в Западной Африке. Это привело к резкому увеличению потока рабов в Суринам и западную Гайану, хотя Кюрасао так и не восстановил свою прежнюю гегемонию в качестве перевалочной базы для рабов после передачи «асиенто» на поставку невольников в Испанскую Америку Британии в соответствии с условиями Утрехтского договора (1713 г.). Во время пика этой торговли, пришедшегося на 1750-1780 гг., в Суринам приходило в среднем по десять невольничьих кораблей в год, привозя от 3 000 до 4 000 рабов.

Во всей нидерландской империи в Азии и южной Африке ОИК была единственной и высшей властью под суверенным контролем Генеральных Штатов. ОИК в Республике управлял федеративный совет директоров, т.н. «Семнадцать господ» (Heren XVII), состоявший из представителей четырех палат Компании. Более того, хотя все палаты были расположены в Голландии или Зеландии, Heren XVII и Генеральные Штаты всегда придерживались принципа, что Компания воплощала и объединяла на федеративных началах коммерцию и дипломатию всех Соединенных Провинций в Азии; и что, в качестве военной организации, содержавшей армии, флоты и гарнизоны, она была дополнением Генералитета. Таким образом, все губернаторы, командующие военными и военно-морскими силами и дипломаты ОИК в Азии и южной Африке всегда действовали в двойном качестве и приносили двойную присягу — Генералитету Соединенных Провинций и ОИК. Когда в 1619 г. Ян Питерсзон Кун, генерал-губернатор Нидерландской Ост-Индии (1619-23 гг. и 1627-29 гг.), основал постоянную штаб-квартиру Компании в новой укрепленной гавани, в Джакарте, выбранное им название для нового города, «Новый Хорн», в честь его родного города, было отвергнуто Heren XVII, которые предложили назвать его «Батавия» именно из-за ее общих северо-нидерландских коннотаций. Главная база Компании в Индии в первые десятилетия ее существования, в Пуликате на Коромандельском побережье, называлась «Форт-Гелдрия». С целью представительства инвесторов от других провинций, кроме Голландии и Зеландии, с 1613 г. Утрехту, Фрисландии и Гелдерланду было выделено по одному из двадцати мест в совете директоров Амстердамской палаты, тогда как Гронинген с 1647 г. имел пост директора в Зеландской палате, а Оверэйссел был представлен в Делфтской субпалате. Существовали также правила, по которым отдельные города в Голландии и Зеландии, где не имелось своих палат ОИК, имели постоянных представителей в палатах. Так, с 1648 г. Харлем и Лейден имели постоянное место в Амстердамской палате, тогда как из двенадцати мест директоров Зеландской палаты девять были закреплены за Мидделбургом, два — за Флюшингом, и одно — за Вером.