Начало войны закономерным образом спровоцировало колоссальный рост бандитизма на всей территории СССР — в 11,9 раза[1070]. Наибольшая часть бандповстанческих групп носила чисто уголовный характер. В то же время часть их имела антисоветскую ориентацию. В Хабаровском крае появились повстанческие группы, созданные бывшими белогвардейцами. В Якутии с сентября 1941 г. действовала подпольная группа Коркина, в начале 1942 г. — Общество спасения России от большевизма. В ноябре 1941 г. в Краснодаре была раскрыта Партия нового порядка, которая ставила своей задачей «свержение Советской власти, восстановление капитализма, создание местного правительства после оккупации Кубани немцами, а также оказание помощи немецким оккупантам в проведении их мероприятий». Партия имела свою программу, которая называлась «Крах Советской империи и задачи русского народа», ей был намечен состав будущего местного правительства, подбиралась кандидатура для поездки в оккупированный Таганрог с целью установления связи с германскими властями. В январе 1942 г. в Усть-Лабинске (Краснодарский край) была раскрыта молодежная организация «Союз друзей России». В сводке прокуратуры особо подчеркивалось, что «все они являются комсомольцами». Организация провела с сентября 1941 г. около двенадцати собраний, на которых обсуждались программные вопросы и методы борьбы с советской властью с целью восстановления в СССР «буржуазного демократического строя». Методом действий был избран «призыв населения к восстанию». В том же регионе была выявлена армянская повстанческая группа. В Грузии националистические группы планировали поднять восстание при приближении оккупантов. В Армении возникли повстанческие группы курдов и мусаватистов. В Средней Азии с началом войны произошла общая активизация «басмаческих элементов». Антисоветские повстанческие группы действовали также в Узбекистане, Туркменистане, Киргизии, Казахстане и Таджикистане. Так, выявленная в Казахстане группа Омарова и муллы Туспекова ставила задачу создания независимого казахского государства[1071].

Политическая ситуация в национальных регионах Северного Кавказа была сложной и до войны. Значительная часть местного населения была недовольна правительственной политикой — в первую очередь коллективизацией сельского хозяйства. Во-вторых, среди некоторых народов региона отмечались отсутствие или слабость просоветской элиты, что создавало ситуацию постоянного кризиса в отношениях между властью и населением. Так, в Чечено-Ингушетии, после репрессий против «кулацко-мулльских элементов» в 1930-х гг. «устойчивость советской власти стала все более сомнительной», а «удары по органичной и далеко не советской социальной и культурной элите вайнахов привели к радикальному ослаблению среди них лояльности к Советскому государству»[1072]. По некоторым данным, в 1940 г. Генштаб РККА предлагал применить в отношении населения ряда регионов Северного Кавказа «специальные меры» в виде депортации[1073]. Так, на территории Чечено-Ингушетии антисоветские выступления происходили в 1925, 1930, 1932 гг. и январе 1941 г. В рамках проведенной с 20 сентября 1937 г. по 1 июля 1938 г. чекистско-войсковой операции в ЧИАССР были ликвидированы 82 банды в составе 400 человек. К началу 1941 г. в этой республике действовала 21 банда в составе 96 человек[1074]. В период с 1 января по 22 июня 1941 г. был выявлен 31 факт бандповстанческой активности[1075].

После начала Великой Отечественной войны в Чечено-Ингушетии начали действовать антисоветские бандгруппы X. Исраилова, целью деятельности которой было «свержение советской власти вооруженным путем и соединение с германской армией», и М. Шерипова, которым удалось организовать разрозненные выступления, в том числе воспользовавшись недовольством антисоветски настроенных жителей трудовой мобилизацией «для выполнения работ, связанных с военными мероприятиями». В январе 1942 г. по приказу наркома внутренних дел Чечено-Ингушской АССР С. И. Албогачиева была проведена оперативно-чекистская операция в высокогорной местности Шатоевского, Итум-Калинского и Галанчожского районов, в результате которой было захвачено 97 бандитов, а остальные скрылись в горах. В июне 1942 г. аналогичная операция была проведена в Шатоевском районе, в результате которой было захвачено 56 бандитов. Всего на территории республики в 1942 г. было проведено 413 операций, в результате которых было ликвидировано 9 кадровых банд в составе 102 человек. Кроме того, было уничтожено 529 бандитов из состава других банд и задержано 3793 человек. Бандповстанческие группы действовали также на территории Эльбрусского района Кабардино-Балкарии, в Карачае и Черкесии. В конце 1941 г. и январе 1942 г. в Кабардино-Балкарской АССР было арестовано 50 участников бандповстанческих групп[1076].

Германское вторжение на Северный Кавказ летом 1942 г. вызвало рост бандповстанческих проявлений в регионе. Наиболее яркими они были во второй половине 1942 г., в ожидании прихода оккупантов и во время их максимального продвижения на Кавказ. В августе 1942 г. группа М. Шерипова численностью в 200 человек разгромила советские и партийные учреждения в селе Химой (райцентр Шатоевского района Чечено-Ингушетии) и сельсоветы в селах Цеси и Дзумсой. Однако при нападении на село Итум-Кале повстанцы были разбиты. В ноябре 1942 г. М. Шерипов был убит. В августе 1942 г. произошло выступление группы И. Магомадова (ликвидировано в октябре 1942 г.). В январе 1943 г. произошло выступление в Учкулановском районе Карачаевской АО. В Дагестанской АССР в сентябре 1942 г. повстанческая группа двое суток безуспешно осаждала райцентр Шаури. В конце 1942 г. в не оккупированных улусах Калмыкии действовали бандповстанческие группы численностью до 150–200 человек. Рост антисоветской повстанческой деятельности в 1942 г. был отмечен также в Азербайджане. Так, в Агдашском районе была раскрыта попытка создать повстанческую организацию из числа местных дезертиров и уклоняющихся от мобилизации, в Закатальском районе была ликвидирована молодежная антисоветская организация, готовившая совместно с одной из повстанческих групп антисоветское выступление «в пользу гитлеровцев» перед ожидаемым вторжением их в Азербайджан[1077].