Во время гражданской войны 68–69 годов Дунай в верхнем течении не пострадал от жестоких вторжений, которым подверглась Мёзия, и Антоний Прим смог привлечь моряков флота для участия в своем итальянском походе.[449]Название Flavia, которое принял Паннонский флот при восшествии на престол Веспасиана, увековечивает это событие и, возможно, отражает действия эскадры против небольших набегов, не удостоенных записи. Впоследствии, помимо волнений, вызванных неудачами Домициана в Мёзии, Паннония оставалась спокойной до самых войн Марка Аврелия с маркоманами. Домициан увеличил ее войска и двинул легионы на Дунай.[450]В 197 году Траян разделил провинцию на Паннонию Верхнюю и Паннонию Нижнюю.

В этом разделении classis Flavia Pannonica был официально закреплен за Нижней Паннонией, для которой Дунай служил границей от Сингидуна и за (выше по течению) Аквинкумом. Но корабли продолжали патрулировать верховья Савы и Дравы в Верхней Паннонии.[451]По Саве, в частности, все еще ходили корабли флота даже после того, как императоры династии Флавиев построили дорогу вдоль важного маршрута между Италией, низовьями Дуная и Малой Азией. Одна морская надпись исходит из города Эмона (современная столица Словении Любляна), расположенного близко от верховьев реки, а другая из Сирмия, ее южного стража. Граффити в качестве обета Юпитеру от триерарха в Петовии (ныне Птуй в Словении) доказывает, что флот заходил в Драву, и надгробия моряков обнаружены в лагерях легионеров в городах Бригеций (ныне здесь Эстергом) и Аквинкум (в пределах современного Будапешта) на Дунае.[452]Сама база ВМС располагалась в Таурунуме (ныне Земун в составе Белграда) близ Сингидуна (ныне в пределах Белграда), стратегического пункта при впадении Савы в Дунай.[453]

История Паннонского флота во II и III веках освещена крайне слабо. Возможно, он взаимодействовал с армией во время войн Траяна с даками или оставался, быть может, в пределах своей зоны действий для охраны границы от вражеских посягательств.[454]Эти корабли стилизованы даже более, чем на колонне Траяна. Проявления их действий по снабжению и транспортировке во время войн с маркоманами всего лишь пародии на траянские прототипы. Можно отметить только, что Паннонский флот, контролировавший лучшую речную побочную линию связи, оказывал поддержку армии сначала из Карнунта, потом из Аквинкума.[455]Временный мир, обеспеченный Марком Аврелием, запретил судоходство по Дунаю обитателям задунайской территории. Это правило, как выяснено, действовало и на Рейне. Однако неудача Коммода развить добытые с большим трудом успехи отца до логического завершения потребовала укрепить оборону на реках фортификациями «per loca opportuna ad clandestinos latrunculorum transitus oppositis» («в удобных местах для пресечения скрытных переправ разбойников»).[456]

Надпись, сделанную Л. Корнелием Реститутом, префектом флота, можно отнести к 201–207 годам. После этого classis Flavia Pannonica исчезает до середины IV столетия. В поздней Notitia основные силы прежнего флота располагались, очевидно, на или близко к реке Сава: выше Карнунта сторожили Дунай milites liburnarii (морпехи) пограничных легионов.[457]

Что касается провинциальных флотов, о которых до сих пор шла речь, то можно лишь утверждать, что они существовали. Как правило, имеются обрывки прямых свидетельств, и исследование в привязке к местности предполагает на выходе их морскую историю лишь в общих чертах. Продвинуться дальше нельзя. Обращаясь к Рейну, мы получаем, наконец, плоть и кровь мельчайших подробностей, и по крайней мере относительно I века мы знаем об истории и географическом положении рейнского флота больше, чем о любой другой эскадре империи, не исключая большие итальянские флоты. Авторы этого периода – Тацит, Веллей Патеркул, Страбон и другие – рассказывают много историй о границе по Рейну. Существует много надписей, и некоторые из них могут быть даже отнесены к периоду до Домициана, правившего в 81–96 годах. Тщательные археологические исследования немецких и голландских ученых оставили мало нераскопанных мест. Богатство материалов не случайно. Число стоянок для германского флота значительно превосходило количество стоянок для любой другой малой эскадры, и все свидетельства указывают на то, что мощь этого флота соответствовала важности границы. Она насыщалась гарнизонами вплоть до правления Домициана.