Хотя эти задачи, видимо, отвлекали время от времени суда флота в Верхнюю Мёзию, никаких признаков наличия постоянных стоянок в этом регионе не обнаружено. Надпись конца II века (III 14567) рекрута из VII легиона Клавдия, который проходил подготовку в качестве epibata, или морпеха, в Наисе (ныне сербский Ниш) на реке Марг (Морава),[441]ни в коем случае не подтверждает существование флотской стоянки в этом месте. Более вероятно, что этот легион располагал своим собственным судном для поставок и патрулирования. В то же самое время такая практика обнаружена и на Рейне, а в IV веке несколько легионов на самом Дунае получили задание патрулировать реку.

В начале III века Мёзийский флот появляется у пограничных камней Добруджи, установленных его префектом по приказу наместника Овиния Тертулла, который обновил демаркацию многих границ на этой территории. От Гордиана Мёзийский флот, подобно всем другим военным подразделениям, получил недолговечный эпитет Гордианский. Некоторые его подразделения, вероятно, пережили оставшуюся часть хаотичного III века, ибо в IV столетии небольшие самостоятельные эскадры базировались на различные, стратегически важные пункты вдоль Дуная. Немаловажные соображения, которые вызвали создание речного флота, сохранялись до тех пор, пока Византийская империя не потеряла Дунай.[442]

Поскольку Паннонию пересекали два судоходных притока Истра – реки Альпис (Сава) и Карпис (Драва), – Римский флот поддерживал экспансию Августа с самого начала. Первые походы под водительством самого императора имели целью захват Сисции (ныне хорватский Сисак), ключевого пункта на севере к реке Сава, поскольку река близко подходит к Карнийским Альпам и представляет, таким образом, наилегчайший путь во все Балканы из Италии. В 35 году до н. э. римские войска подчинили племя япидов, разгромили пиратов Далмации и осадили саму Сисцию с реки и суши. Местный дружественный царек прислал с Дуная по Саве суда, а другие корабли были построены римлянами, возможно, с помощью моряков, доставленных из Средиземноморья. Командовал флотом Менас, печально известный вольноотпущенник Секста Помпея, который погиб в сражении с примитивными ладьями местных жителей.[443]Когда Сисцию наконец взяли и сделали римской крепостью, римская флотилия, которую Октавиан (будущий Август) сформировал для дальнейших операций, вероятно, оставалась там в полной готовности.

Угроза, а потом реальность гражданской войны наряду с проблемами ее разрешения мешали дальнейшим операциям в среднем течении Дуная до тех пор, пока в 15 году до н. э. план похода Августа в Паннонию не продолжили методично сначала Агриппа, потом Тиберий. К 12 году до н. э. Дунай в своем среднем течении мог формально считаться границей.[444]Поскольку Сирмий, ключевой пункт на Саве, находился к этому времени в руках Рима, возможно, что Сава обеспечила вторичную основную линию коммуникаций и что теперь с рубежа этой реки экспансия римлян была направлена на север к Дунаю. На последних этапах похода Тиберия Драва, текущая к Дунаю параллельно Саве севернее, могла быть использована таким же образом. Представляется, что флот получил прекрасное использование в десантных операциях на берегах Дуная в тылу местных очагов сопротивления.

Помимо недостаточно разработанных операций на противоположном берегу Дуная в Дакии, которые обусловили поддержку флота, базировавшегося на Сисции, среднее течение Дуная больше не было свидетелем серьезных акций.[445]Однако восстание в Паннонии в 6 году н. э. вынудило Тиберия отвлечься от войны с Марободом в Южной Германии. Цецина Север, командир легионов Мёзии, освободил Сирмий от осады повстанцев. Тиберий надежно удерживал Сисцию, и в 7 году подкрепления из восточных легионов пробились к Саве. Овладев рубежом Савы, Тиберий уверенно двинулся дальше и к 9 году покончил с повстанцами. Вскоре после подавления этого мощного восстания Паннония стала провинцией и получила на постой три легиона для охраны границы и умиротворения местного населения. VIII легион Августа расположился внутри страны у Дравы в Петовионе (Петовии, ныне Птуй). IX Испанский легион, видимо, находился в Сисции для защиты от внезапных набегов Италии. Лишь XV легион Аполлинарий дислоцировался на Дунае, вероятно, в Карнунте. Его перебросили из Норика в Паннонию. Praesidia (гарнизон) вспомогательных войск, видимо, удерживал правый берег Дуная вдоль его большого изгиба от Карнунта до Сингидуна. Левый берег сторожило буферное государство свевов, чей царь Ванний был возведен на престол римлянами в 19 году н. э.

Сама река патрулировалась classis Pannonica, который выдвигался с Савы на какое-то время. В 50 году, когда свевы изгнали Ванния, римский флот доставил его через Дунай на территорию империи.[446]Его преемники сохраняли дружбу с Римом, а языги (язиги), проникавшие в широкий входящий угол между Дунаем и Тисой, были настроены пока доброжелательно. Classis Pannonica, видимо, не заходил дальше Карнунта. Ведь гермундуры, располагавшиеся напротив провинций Реция и Норик, образовали еще одно последовательно дружеское буферное государственное образование.[447]Следует заметить, что на озерах между Рейном и Дунаем не было флота до тех пор, пока уход из agri decumates (Декуматских, то есть Десятинных, полей) в конце III столетия не оставил эту территорию открытой для прямых нападений германцев.[448]