Морской министр 3 декабря 1941 года одобрил подобную модернизацию для Атлантического флота (27-я, 30-я и 31-я эскадры эсминцев). Скоро такие же работы были санкционированы и для Тихого океана, и в конечном счёте программа переоборудования включила конверсию эсминцев в лёгкие минные заградители и быстроходные тральщики. К февралю 1942 года только эскадренные миноносцы Азиатского флота (29-я эскадра) не были назначены на модернизацию. Дополнительное топливо наглядно показало значительные различия того, что было с тем, что стало. Согласно списку Атлантического флота от мая 1943 года корабли класса "Уайксов" с тремя котлами могли давать 28 - 30 узлов при полной загрузке против 30 - 32 узлов кораблей с четырьмя котлами; их дальность плавания на экономичной 11 -12-узловой скорости составляла 4.300 - 4.500 миль, сравнимыми с 3.200 - 3.500 милями не переоборудованных кораблей, или 3.000 - 3.200 против 2.000 - 2.200 миль при 75% мощности. Эти цифры базировались на топливовместимости в 385,7 т конверсированного корабля и на 289,6 т для стандартного эсминца. Усовершенствования "Клемсонов", на которых уже проводились работы по увеличению дальности плавания, были менее заметны: 4.400 - 4.600 миль против 3.900 - 4.100 миль на экономичной скорости и 3.600 - 3.900 против 2.800 - 3.100 при мощности 75% от максимального (457,1 т против 396,4 т).

Таким образом, увеличение радиуса действия эсминцев класса "Уайкс" было гораздо более существенной причиной для переоборудования, чем для их более "дальнобойных" систершипов. Оценив новые возможности переоборудованных кораблей, командование Тихоокеанского флота к июню 1942 года настаивало на переоборудовании уцелевших эсминцев Азиатского флота (DD-211, DD-213, DD- 216... DD-218, DD-222, DD-226, DD-228h DD-230) ввиду больших расстояний и отсутствия достаточного количества баз на Тихом океане. Однако на тот момент это сделать было невозможно: переоборудование требовало целых пяти недель на верфи, в то время как эскортных кораблей катастрофически не хватало. Поэтому в июле главнокомандующий вооружёнными силами США на Атлантике предложил неопределённую отсрочку для переоборудования "Клемсонов". Программа возобновилась, но в ноябре 1943 года главнокомандующий вооружёнными силами США на Атлантике свернул её, отодвигая неопределённый срок конверсию последних пяти единиц - DD-210, DD-221, DD-24G, DD-248h DD341 (DD-248 "Барри" скоро был переоборудован в быстроходный транспорт APD-29 с потерей двух котлов). Кроме того, "Симс", классифицировавшийся, как вспомогательное судно АС- 24, но несший практически полное вооружение эсминца, так и не потерял ни одного из своих котлов.

Гладкопалубники обычно обслуживали маршруты конвоев, где универсальное артиллерийское вооружение было менее важным, чем противолодочное. Все они лишились торпедных аппаратов, компенсированных запасом глубинных бомб и шестью 20-мм автоматами (пять - на кораблях с 76,2-мм/50-клб орудиями). Некоторые корабли также имели по бомбомёту "Хеджехог", разработанному Королевским флотом. Уже в марте 1942 года командующий морскими операциями предложил широкую установку этой системы оружия на всех гладкопалубниках - предполагалось заменить ими носовое орудие. Командующий Миноносными Силами Атлантического флота требовал испытаний установки на гладкопалубниках, но ограничивал количество тестируемых кораблей до четырёх единиц, пока не будет продемонстрирована эффективность нового оружия. Командование миноносными силами Тихоокеанского флота, имея ввиду дневную тактику противолодочной борьбы, рассматривало "Хеджехог" достаточно полезным против погружённой подводной лодки в течение дневного времени, но задавалось вопросом, удовлетворит ли ночью для борьбы с подводным противником остающийся залп двух 102-мм орудий (единственного наличного оружия, наиболее эффективно действующего в ночных условиях). Вообще эсминец являлся основным противником подлодок, так как ни один другой корабль не справлялся с вражескими подводными лодками, и они вполне могли прорываться сквозь охранение, используя и орудия, и торпеды. С другой стороны, английский флот сумел сохранить и носовое орудие и "Хеджехог" на переданных им гладкопалубниках.

Фактически на американской службе компенсация была ограничена установкой 20-мм автомата и двумя бомбомётами. Обычно два залпа "Хеджехога" держали в готовности в пусковых установках и ещё пять в погребе. В мае 1943 года первый заместитель командующего морскими операциями заказал для Атлантического флота их установку на десяти гладкопалубниках: DD-109, DD-118, DD-128, DD-142, DD-144, DD-145, DD152, DD-220, DD-223 и DD-341. Кроме того, два эсминца обслуживали Подводные школы - для этих целей были приспособлены DD-113 "Рэтборн" и DD-187 "Дальгрен". В мае 1944 года "Рэтборн" был переоборудован в быстроходный транспорт APD-25 и заменён в Подводной школе эсминцем DD-109 "Крейн". DD-24G "Бэйнбридж", намеченный для переоборудования в быстроходный транспорт, получил "Хеджехог". Силы эсминцев, оснащённые "Хеджехогами", уменьшились до девяти эксплуатационных единиц, когда DD-152 "Дюпон" в сентябре 1944 года был низведён до статуса вспомогательного судна.

Гладкопалубники не считались достаточно прочными, чтобы получить чересчур тяжёлые зенитные батареи. Единственным исключением оказались два корабля, направленные на Средиземноморье - DD-220 "Мак-Лейш" и DD-223 "Мак- Кормик". Как и на более молодых систершипах, работавших там в июне 1944 года, на них сменили оставшиеся торпедные аппараты на одноствольный 40-мм автомат М1А1 армейского образца.

Вспомогательные корабли были модернизированы более обширно. Хотя минзаги сохранили свои первоначальные артбатареи, на быстроходных тральщиках планировалась установка 76,2-мм/50-клб пушек вместо их 102-миллимитровок уже в 1942 году. В то время стандартным вооружением быстроходных транспортов были четыре четырёхдюймовки, как на APD-1 "Менли". У всех плавбаз гидроавиации их 4-дм пушки должны были замениться парой 76,2-мм/50- клб зениток. Вероятно, четырёхдюймовки на быстроходных транспортах были сохранены для возможности вести кораблями поддерживающий десантников огонь.

К 1943 году быстроходные транспорты также имели но четыре 3-дм универсальных пушки вместо их прежней батареи. С 1944 года для них был окончательно определён следующий состав вооружения: три 7б,2-мм/50-клб зенитки, два одноствольных армейских Бофорса на месте кормового орудия, пять Эрликонов, Herald бомбомёта и один бомбосбрасыватель. К тому времени и на быстроходных тральщиках были установлены по две - три 76,2-мм/50-клб зенитки и спаренный Бофорс. Часто к поступавшим с заводов обычным "универсалкам" добавлялись, увеличивая их общее количество, орудия, снятые с подводных лодок, перевооружаемых более мощной артиллерией. Минные заградители были также перевооружены на обычные трёхдюймовки. В 1944 году их окончательно утверждённая батарея была идентично"! таковой на тральщиках DMS.

Многие из вспомогательных кораблей использовались в военное время в качестве эскортных. В частности, строящиеся плавбазы гидроавиации типа "Барнегет" скоро начали заменять своих "пожилых" предшественников, девять из которых в конце 1943 года вернули себе статус эсминца. Однако они не были перевооружены и переоснащены для несения службы эскадренного миноносца (как того требовал бы данный класс кораблей) и отличались от однотипных кораблей наличием только двух котлов и двух трёхдюймовок.