Флотские контрразведчики в сентябре 1941 г. отмечали недостатки в ведении секретного делопроизводства, грубые нарушения в хранении секретных документов, их утерю, в частности пропажу трех страниц секретного приказа по личному составу УОК, создании предпосылок к разглашению государственной тайны. О недостатках ведения секретного делопроизводства своевременно информировалось командование УОК, но реальные меры по упорядочению этой работы были предприняты только после проведения расследования по факту утраты страниц секретного приказа.

Практически не изменилась ситуация с организацией деятельности УОК и в сентябре 1941 г. Об этом свидетельствует очередное тревожное сообщение, направленное в Москву, о состоянии отряда и предложения по устранению недостатков:

«1. Дать Учебному отряду хотя бы те корабли, которые предусмотрены приказом НКВМФ № 00203, для обеспечения правильной постановки боевой подготовки штаба как органа боевого управления.

2. Пересмотреть вопрос о численности кораблей флотилии (необходимо их увеличить, особенно канлодок), об их вооружении, живучести и оборудовании.

3. Дать Учебному отряду положенное вооружение и боезапас.

4. Дать отряду оперативную задачу и потребовать от его командира мобилизовать личный состав отряда на выполнение поставленной задачи»[564].

В августе 1941 г. флотские контрразведчики сигнализировали о минной опасности на Волге. На основании полученных из Особого отдела Учебного отряда данных Транспортное управление НКВД СССР информировало заместителя начальника УОО НКВД СССР С.Р. Мильштейна о том, что борьба с вражеской авиацией, а также защита флота от мин, сбрасываемых противником с самолетов, организованы плохо. Траление фарватера р. Волги производилось неудовлетворительно. Командование заявляло, что оно беспомощно вести борьбу с минами новых образцов, сбрасываемых немцами. ТУ НКВД просило Мильштейна «лично принять меры воздействия на соответствующие инстанции Наркомвоенморфлота в деле усиления защиты речного флота от вражеской авиации и своевременного очищения русла р. Волги от вражеских мин»[565].

Ухудшение обстановки на фронтах побудило руководство НКВМФ в октябре 1941 г. сформировать из кораблей Учебного отряда и мобилизованных судов волжских речных пароходств — Волжскую военную флотилию (ВВФ, база — в Ульяновске). Перед флотилией ставились задачи содействия сухопутным войскам и обеспечения обороны стратегической водной коммуникации.

Все организационные мероприятия предполагалось завершить к 1 апреля 1942 г.

В июле 1942 г. ВВФ имела 7 канонерских лодок, 14 бронекатеров, 33 катера-тральщика, 2 плавучие зенитные батареи, железнодорожную батарею и 2 батальона морской пехоты. Флотилия производила траление мин, поставленных авиацией противника на Волге от Астрахани до Саратова, конвоировала караваны и отдельные суда с воинскими и народнохозяйственными грузами[566].

Во время Сталинградской битвы, с 24 июля 1942 г. до конца января 1943 г., ВВФ в составе 1-й и 2-й бригад речных кораблей была оперативно подчинена командующему войсками Сталинградского фронта. Корабли флотилии оказывали артиллерийскую поддержку сухопутным войскам фронта, высаживали десанты, обеспечивали перевозки войск и грузов через Волгу в черте города и в полосе 57-й[567] и 64-й армий[568], осуществляли противоминную и противовоздушную оборону водных перевозок по Волге.

Силы флотилии вступили в войну в августе 1942 г., когда немецкие войска вышли к Волге у Сталинграда, а водная коммуникация от Куйбышева до Астрахани оказалась в зоне действия авиации противника. В разгар боев в Сталинграде контрразведчики флотилии вели жесткую борьбу с дезертирами, паникерами, применяя и такую крайнюю меру, как расстрел на месте.

12 октября 1942 г. перед строем моряков 1-й бригады бронекатеров, по постановлению Особого отдела ВВФ, были расстреляны три моряка этого соединения. Следствием было установлено, что 9 октября 1942 г. три члена экипажа бронекатера № 31 сбежали с подбитого корабля, бросив оружие и оставив без помощи раненых бойцов и командиров, эвакуируемых женщин и детей, большая часть из которых погибла[569].

В дни Сталинградской битвы контрразведчики флотилии принимали участие в патрулировании на территории огневых позиций кораблей и облавах по задержанию подозрительных лиц. В результате было задержано и подвергнуто фильтрации сотрудниками ОО НКВД флотилии 188 человек, из них: дезертиров — 149, прибывших с оккупированных территорий — 11, подозрительных элементов — 28. Все они были переданы в заградительные отряды и оперативные группы ОО НКВД 57-й и 64-й армий. За период с 20 августа 1942 г. по 20 августа 1943 г. из подразделений флотилии дезертировали 38 человек, из которых 21 был розыскан и арестован.

Анализ состояния внутренней и корабельной службы в подразделениях флотилии, проведенный сотрудниками контрразведки, показал, что причинами, порождавшими и способствовавшими дезертирству, являлись: незнание командирами различных степеней (младшими командирами, командирами подразделений, а также командирами частей, кораблей и их заместителями по политической части) своих подчиненных; неудовлетворительное состояние организации службы в частях, на кораблях, слабая политико-воспитательная работа по разъяснению воинских преступлений, в том числе и дезертирства; несвоевременное пресечение попыток дезертирства со стороны командования отдельных частей, подразделений, кораблей, а в отдельных случаях скрытие фактов дезертирства; небрежное хранение в отдельных частях бланков, штампов, печатей, отсутствие систематического контроля и проверки работников секретных частей и находящейся в них документации[570].