М.В. Фрунзе до этого времени руководил действиями войск на территории Туркестана, находясь со своим штабом в Самаре. В Ташкенте распоряжался В.В. Куйбышев. Только 22 февраля 1920 года Михаил Васильевич сам с полевым штабом переехал в этот город. Оттуда он сразу же направился на фронт, где лично убедился в плохом состоянии войск. В телеграмме В.И. Ленину, отправленной с Кушки 24 марта 1920 года, Михаил Васильевич писал: «Личное ознакомление с состоянием воинских частей фронта, начиная от Ташкента, кончая районами Красноводска и Кушки, дало самую безотрадную картину. Численный состав ничтожен. Так, например, на весь район 1-й армии от Термеза до Красноводска имеется налицо 4500 штыков и 700 сабель.

…Все части представляют неописуемый сброд. Пограничная охрана отсутствует. Вооружение войск разнокалиберное. Таким образом, в военном отношении мы сейчас представляем ничтожество…»

Для улучшения состояния войск М.В. Фрунзе провел в Туркестане мобилизацию местного населения призывного возраста. В результате было получено более 25 тысяч пополнения. На их хорошую профессиональную подготовку не было времени. Едва подготовленных бойцов, многие из которых плохо владели русским языков, поспешно вооружили и влили в состав действующих частей и подразделений.

Центром движения басмачей стала Фергана. Нарушение там сельскохозяйственной жизни в годы Гражданской войны, неурожай 1918 года, разобщение Туркестана с основной территорией России и прекращение подвоза туда хлеба вызвали очень тяжелое экономическое положение края. Оно еще более усугублялось жесткими хлебными и другими поборами. Это стало одной из причин роста и усиления басмачества.

Ферганский фронт, направляемый на борьбу с басмачеством, образовался в феврале 1919 года. М.В. Фрунзе не только усилил этот фронт, но и начал активную работу за разложение населения Ферганы. Он издавал и распространял воззвания «К мусульманскому населению Ферганской области». В одном из таких воззваний от 24 мая 1920 года он, в частности, писал: «Два с лишним года льется кровь по всей Фергане; два с лишним года измученное население области не знает отдыха и не может спокойно трудиться; два с лишним года шайки басмачей терроризируют мирных жителей, угоняя их скот, забирая жен и сыновей, лишая последнего достояния.

К сожалению, надо признать, что большая доля вины за это ложится на самую власть Ферганы. Надо признать, что первые представители и организаторы Советской власти в Фергане не оказались на высоте своего положения… В ряды Советской власти проникло тогда много элементов, не имевших ничего общего с революцией, которые занимались набиванием собственных карманов путем насилия над населением».

Советская власть действовала решительно. В ход шла агитация, уговоры, подкуп, прямые военные действия. В результате басмачество было частично разгромлено, частично — подавлено.

В первой половине 1920 года стала совершенно очевидной подготовка эмира бухарского к вооруженному выступлению против Советского Туркестана. 22 мая 1920 года М.В. Фрунзе докладывал В.И. Ленину: «Сложившаяся за последнее время политическая и военная обстановка в Туркестане заставляет с уверенность говорить о неминуемости в самом близком будущем военных операций в широком масштабе. Фактически таковые уже начались в Фергане сильной вспышкой басмаческого движения, потребовав от нас самого серьезного внимания. Это движение не является изолированным, оно состоит в самой тесной связи с военными приготовлениями Бухары и Афганистана».

В Бухаре проводилась мобилизация части населения, было налажено получение оружия из-за границы, в городе появились английские военные инструкторы, был организован штаб, которого не существовало раньше. Кроме того, о подготовке к выступлению сообщали лазутчики, которым советское командование щедро платило.

М.В.Фрунзе и его штаб внимательно отслеживали эту подготовку и заблаговременно предпринимали ответные меры. Были усилены гарнизоны на железной дороге, которая вела с территории России к Новой Бухаре, войска получили пополнения в живой силе и материальной части, были восстановлены и проложены новые телеграфные линии.

Кроме прочих, для овладения Туркестаном требовалось разгромить также и семиреченское казачество. Обстановка в Семиречье была очень сложная. В марте 1918 года местное население этой богатой области отказалось признавать советскую власть. Затем туда ушла крупная войсковая группировка атамана Анненкова, отколовшегося от Колчака. Образовался Семиреченский фронт.

К моменту вступления М.В. Фрунзе в командование Туркестанским фронтом войска Семиреченского фронта вяло вели боевые действия. С обеих сторон была низкая воинская дисциплина, солдаты, в большинстве из числа местных жителей, часто дезертировали, а то и переходили на сторону противника, командование имело низкую тактическую подготовку и авторитетом не пользовалось.

2 марта 1920 года М.В. Фрунзе обратился к семиреченским казакам с воззванием, в котором, в частности, писал: «Я, как командующий всеми вооруженными силами Республики в пределах Туркестанского фронта и сам сын Семиречья, именем Российской Социалистической Федеративной Советской Республики объявляю всем казакам, киргизам и прочим, сражающимся ныне против Красной Армии, гарантию полной личной безопасности и забвение всех проступков, совершенных против рабоче-крестьянской России при условии немедленного изъявления ими покорности, сдачи всех запасов оружия и военного снаряжения».

О положении дел в Туркестане 14 апреля 1920 года Михаил Васильевич, в частности, докладывал В.И. Ленину:

«…Последняя заноза на теле фронта — Северо-Семиреченский район — ныне благополучно вынута, и фактически военные операции в более или менее крупном масштабе закончились. Остается еще несколько неликвидированных басмаческих шаек в Фергане и в Ура-Тюбинском уезде (в горах) Самаркандской области, на границах с Бухарой. Но эти шайки по существу своих задач и по методам борьбы являются чисто разбойничьими организациями…

Что до положения в самом Туркестане, то он разделен разногласиями двух группировок, выросших на почве самого Туркестана. Одна, представляющая местный "пролетариат" и сильно окрашенная цветом так называемого "колонизаторств". Другая, представляемая кучкой мусульманской мелкобуржуазной интеллигенции, выдающей себя за выразителей мнения всей многонациональной массы мусульманства. Все здесь вращается вокруг борьбы этих группировок…»

По моему мнению, это было вызвано несколько неправильным тактическим курсом, который был взят в отношении всего русского населения на первых порах. Это проявилось в сплошном охаивании всего европейского населения…

Стремясь урегулировать политические страсти, М.В. Фрунзе обратился к местному населению с воззванием соблюдать спокойствие и позволить местным органам разобраться во всех претензиях и разногласиях. Но воззвание не подействовало.

12 января 1920 года начался мятеж гарнизона в столице Семиречья городе Верном (ныне Алма-Ата). Непосредственным поводом для событий послужило нежелание красноармейцев одного из батальонов 27-го полка выполнить приказ командующего Туркестанским фронтом и отправиться в Фергану для борьбы с басмачами. Крестьяне-семиреченцы, составлявшие большинство красноармейцев гарнизона, не желали уходить из родных мест. Кроме того, красноармейцы батальона выражали недовольство хлебной монополией.