После оккупации фашистской Германией Польши советским пограничникам было приказано принять под охрану новую демаркационную линию по всей западной границе, не прекращая охраны государственной границы на прежних рубежах. Уже в сентябре 1939 года 15 новых пограничных отрядов вышли на ее охрану. За 1940–1941 гг. пограничные заставы этих отрядов были доведены до 60–80 человек, вооружены новейшими образцами стрелкового оружия: автоматической винтовкой Симонова, пулеметами Дегтярева и «максим», ротными минометами. В пограничных отрядах были созданы хорошо оснащенные маневренные группы, а в Киевском, Белорусском, Ленинградском и Прибалтийском пограничных округах – оперативные полки, как резервы начальников войск этих округов.

К зиме 1939 года резко обострилась обстановка на границе с Финляндией. Несмотря на все дипломатические усилия Советского Союза, взрывоопасная обстановка переросла в войну. В боях по прорыву финских укреплений активное участие приняли пограничники Северо-Западного пограничного округа. В частности, авиация пограничников проводила разведку, доставляла оружие и боеприпасы воюющим подразделениям.

В предвоенный период была проведена перегруппировка частей отдельной пограничной авиабригады. Так, на Дальнем Востоке остались всего две отдельные авиаэскадрильи: 2-я морская на участке Тихоокеанского пограничного округа и 5-я морская на участке Хабаровского пограничного округа. На Среднеазиатской границе остались 3-я авиаэскадрилья в Алма-Ате (Казахский погранокруг), 4-я – в г. Мары (Туркменский погранокруг), 8-я – в Ташкенте (Среднеазиатский погранокруг). Западная граница была значительно усилена 7-й морской авиаэскадрильей в Одессе (Украинский погранокруг), 10-й – в Гродно (Белорусский погранокруг), 6-й – в Коктебеле (Крымский погранокруг), 1-м отдельным гидроавиазвеном на Новой Ладоге (Ленинградский погранокруг), 2-м отдельным гидроавиазвеном на оз. Ягодник (Мурманский погранокруг). Кроме того, 1-я Быковская отдельная авиаэскадрилья, как резерв начальника погранвойск, постоянно усиливала западное и северо-западное направления. Экипажи эскадрильи месяцами находились в командировках на западной границе и на границе с Финляндией.

В октябре 1939 года для оперативного использования самолетов на участке Украинского пограничного округа была сформирована 11-я отдельная авиаэскадрилья в городе Броды. Первым командиром эскадрильи был назначен подполковник В. Филиппов, заместителем по политчасти – батальонный комиссар Костомаров, начальником штаба – майор Халюк. Позднее она была частично перебазирована на остров Сааремаа (Эзель), в Кингисепп. Командиром островной авиачасти стал майор Н. Петров, начальником штаба – капитан В. Абрамкин, заместителем по летной подготовке – капитан П. Самохин. Руководящий и летный состав этой новой авиачасти погранвойск был в основном укомплектован опытным летным составом управления и штаба авиабригады Быково. Эта эскадрилья получила на вооружение 10 самолетов СБ, 2 Р-5, кроме имеющихся 6 гидросамолетов МБР-2бис.

В приказе начальника войск Прибалтийского пограничного округа НКВД СССР генерал-майора Ракутина от 5 октября 1940 года «Об оперативном использовании 11-й авиаэскадрильи НКВД в охране государственной границы» была поставлена задача: «с 15 октября с.г. 11-й авиаэскадрилье, перебазировавшейся на о. Эзель, приступить к охране государственной границы на участке округа; самолетам Р-5 нести охрану границы по западному побережью о. Эзель и о. Даго на участке 10-го пограничного отряда НКВД; самолетам СБ и МБР-2 нести охрану границы в пределах 12-мильной морской зоны от Нарвского залива на стыке с Ленинградским пограничным округом до порта Швентой на левом фланге участка округа». Далее были поставлены задачи командиру эскадрильи, всем начальникам пограничных отрядов и командирам морских бригад, даны указания по связи и материально-техническому обеспечению.

Необходимо отметить, что после получения самолетов СБ личному составу островной эскадрильи пришлось расширять стоянки и удлинять взлетно-посадочную полосу своего аэродрома Курессааре (Кингисепп) и запасных аэродромов Кагул и Асте. Но как же это пригодилось в начале войны! Именно с этих аэродромов с 8 августа по 5 сентября 1941 года советская дальняя авиация под командованием полковника Е.Н. Преображенского на самолетах ДБ-Зф (Ил-4) бомбила Берлин. По кратчайшему расстоянию через Балтийское море до Берлина было 1760 км, что соответствовало максимальному радиусу действия этих типов самолетов. Ими было сделано десять полковых боевых вылетов по военным объектам в районах Берлина, Данцига, Штеттина, Кенигсберга и сброшено 311 авиабомб крупного калибра.

Таким образом, уже за два года до начала Великой Отечественной войны более половины авиачастей отдельной авиабригады погранвойск «работали» в интересах самого напряженного, тревожного и беспокойного участка государственной границы СССР – ее западных рубежей. К тому же накануне Великой Отечественной войны руководство пограничных войск приняло ряд мер по совершенствованию использования авиации в охране государственной границы СССР.

Во-первых, в августе 1940 года начальником погранвойск НКВД была утверждена «Инструкция по взаимодействию авиационных, морских и сухопутных частей пограничных войск», которая сняла многие острые вопросы, возникавшие при совместных поисках и задержаниях нарушителей государственной границы, а также узаконила порядок применения оружия экипажами самолетов по нарушителям госграницы.

Во-вторых, учитывая обострение обстановки на границе, начальник пограничных войск НКВД в приказе от 7 декабря 1940 года «О задачах боевой подготовки» потребовал от авиации погранвойск постоянной готовности к действиям в составе эскадрильи, отдельными звеньями и самолетами для выполнения боевых задач на границе в сложных метеоусловиях (в облаках, на малых высотах при ограниченной видимости и т. д.), к маневру в условиях частой смены аэродромов, ведению борьбы с парашютными и морскими десантами противника.

Несмотря на то что непосредственно для охраны границы не требовалось бомбометания с различных высот, воздушная стрельба из пулеметов по конусу и по мишеням на земле, выброска парашютистов – эти элементы боевой подготовки летчиков тщательно отрабатывались личным составом авиачастей погранвойск. Как оказалось, такой метод подготовки летчиков-пограничников оправдал себя в будущем.

В-третьих, в сентябре – ноябре 1940 года командование авиабригады осуществляло внезапные проверки боевой готовности всех авиачастей погранвойск. По результатам проверок был издан приказ о поощрении отличившихся и наказании виновных. Требования к командованию и летному составу авиачастей становились все более жесткими, так как к тому времени обстановка на границе обострилась: участились нарушения границы и увеличилось количество всевозможных предпосылок к их нарушению. Экипажи самолетов в создавшейся обстановке более активно привлекались к охране границы. По данным пилотов, пограничные наряды и корабли все чаще стали задерживать нарушителей. Поэтому нагрузка по налету на авиачасти западной, южной и дальневосточной границ значительно возросла.

Перед самой войной в приказе начальника погранвойск НКВД СССР генерал-лейтенанта Г. Соколова от 9 января 1941 года «О маскировке аэродромов пограничных авиачастей» было одноначно сказано, что боевая работа авиации в современной войне немыслима без системы тщательной маскировки всех аэродромов, создания ложных аэродромов и маскировки всей авиационной техники и материальной части. В приказе предлагалось начальникам пограничных войск НКВД округов, имеющих в подчинении авиачасти, к 1 июля 1941 года провести маскировку всех основных и оперативных аэродромов пограничных авиачастей и составить план-схему маскировки на каждый аэродром. Командиру авиабригады предписывалось обеспечить штабы войск пограничных округов и авиачастей «Инструкцией по маскировке аэродромов», камуфляжную окраску самолетов произвести аналогично окраске, применяемой в ВВС Красной Армии, а также дать указание авиачастям о заготовке необходимых легких переносных маскировочных материалов применительно к каждому аэродрому.