9 января 1919 г. РВСР в своем секретном приказе № 34 уточнил схему организации агентурной разведки на фронте: «В целях объединения ведения и организации тайной (агентурной) разведки в действующей армии РВСР постановил: 1) штабам военных округов Московского. Ярославского. Западного, Уральского и Приволжского передать все органы агентурной разведки и кредит на них в соответствующие штабы фронта или армии; 2) штабам Петроградского и Орловского военных округов продолжать вести агентурную разведку впредь до особого распоряжения; 3) для согласования и общего руководства ведения агентурной разведки подчинить агентуру штабов фронтов и входящих в их состав армий (через штабы фронтов) Регистрационному Управлению Полевого Штаба РВСР; 4) кредит на ведение агентурной разведки штабов фронтов и округов (не входящих в состав армий) испрашивать через Регистрационное Управление».

Поскольку Аралов занимал также должности комиссара ПШ и члена РВСР, он практически все время находился вместе с ПШ в Смоленске, где располагались также РВСР и Ставка главкома, а также в Серпухове. Поэтому в Региструпре появилась должность, не предусмотренная штатом. «В порядке внутренней службы и всего обихода все служащие Регистрационного Управления подчиняются тов. Павулану. который назначен постоянным заместителем начальника Регистрационного Управления» (приказ по ПШ РВСР № 47 от 8 ноября, параграф 6). Распределение обязанностей в руководстве Управления между техническим составом (консультанты) и политическим (комиссары) Аралов разъяснил в своей телеграмме, направленной в Москву 23 февраля 1919 г.: «Штатом Региструпр предусматривался Начальник Управления и Консультант. На Консультанта возлагается специальное хозяйственное внутреннее руководство. На Комиссаров и меня политическое и выбор агентов в политическом отношении. Инструктирование же агентов и задание и поверка их знаний возложить на консультантов. Ввиду своих частых отъездов и отсутствием из Москвы я своим приказом, а не штатом назначил заместителем тов. Павулана для решения неотложных политических вопросов. Предлагаю держаться лично штатов и приказом и работать в полном контакте и взаимодействии комиссаров и специалистов каковое до сих пор было…»

Уже на следующий день после утверждения первого состава сотрудников Региструпра в нем произошли изменения: начальник Агентурного отдела В.Ф. Тарасов отбыл на фронт, а его обязанности стал исполнять с 9 ноября начальник Агентурного отделения Г.Я. Кутырев. На посту начальника отделения Кутырева сменил его помощник В.А. Срывалин. Оба они выпускники АГШ 1917 г.

Из Москвы Аралову шли телеграммы о состоянии дел в разведке, вот некоторые из них: 5.01.1919. «Дано задание Рахия и двум резидентам [в] Прибалтике». 10.01.1919. «Продвижение армии на запад постепенно снимает налаженную по линии Либава — Ковно — Брест-Литовск — Ковель — Мозырь агентурную сеть, таковая теперь продвигается к важнейшим в военном отношении пунктам пограничной полосы Восточной Пруссии и важнейшим железнодорожным узлам и населенным пунктам Польши». 15.01.1919. «Наша военная организация [в] Киеве разогнана, многие арестованы, из спрятанных организацией тысяча винтовок, 60 пулеметов и четыре орудия петлюровцами разысканы и забраны. Работа прекратилась». Последние данные сообщил в Региструпр начальник разведывательного отделения штаба Западной армии А.И. Кук.

Кстати, работу самого Александра Ивановича РВС названной армии оценивал довольно высоко: «…его неустанными трудами организована и поставлена на должную высоту войсковая и агентурная разведка на широком фронте от границ Латвии до границ Украины, захватывая глубину последней области. При современном положении, при постоянных переменах политических конъюнктур и связанных с этим перемещениях неприятельских войск и глубоких изменениях в их организции и группировках выяснять их положения, настроения, численность. их организацию и тактические предположения являлось делом трудным и требовавшим особых, высоких способностей. Генерального штаба Кук справлялся с этой задачей с полным успехом, всегда, по первому требованию предъявляя в доклад сведения о противнике в той полноте, какую можно было к ним предъявить».

19 февраля 1919 г. начальник 1-го отделения 1-го отдела Региструпра Срывалин направил начальнику 1 — го отдела Кутыреву доклад, в котором подробно охарактеризовал состояние агентурной работы, отметил ряд серьезных недостатков, характерных для периода Гражданской войны. А их в то время было немало и в самой службе, и по отношению к ней. Главные среди них: кадровый голод (просто не хватало людей и тем более хоть как-то подготовленных): связанная с этим текучесть кадров, в том числе командных; как правило, отсутствие оперативной связи; во многих случаях несогласованность действий между спецслужбами, а также и с органами власти в центре и на местах; у некоторых ответственных лиц присутствует непонимание того, зачем вообще нужна разведка; весьма тяжелые условия жизни.

«15 февраля с. г. исполнилось десять месяцев существования органа агентурной военной разведки, начавшего свою деятельность сначала под названием "Разведывательного Отделения Московского Областного Военного Комиссариата’', затем перешедшего в ведение Оперативного Отдела Наркомвоен и ныне состоящего при Регистрационном Управлении Полевого Штаба Реввоенсовета Республики.

За этот десятимесячный период времени накопилось много материала, который позволяет в достаточной степени выяснить те условия работы, в которых протекает деятельность высшего ныне органа агентурной разведки. Из доклада… будет видно, какие причины не благоприятствовали до сего и в дальнейшем будут мешать получению достаточно ценных результатов агентурной разведки…

Общие принципы, которыми руководствовалось отделение в своей агентурной работе… Правильная организация разведки должна считаться столь же необходимой, как и организация вооруженных сил Государства и должна быть неотъемлемым их дополнением, иначе армия явится лишь слепым организмом… Разведка не может быть делом импровизации и кустарничества, ибо она основывается на деятельности сети мелких тайных агентов, которые должны быть выбраны с большим разбором, затем подготовлены и натасканы и, наконец, еще испытаны раньше, чем считать возможным довериться их донесениям, которые нередко должны лечь основанием важных военных операций. Организация разведки, таким образом, требует значительного времени и изучения агентов. Разведка должна вестись настойчиво и непрерывно и связь с агентами должна быть надежной. Работа тайной организации за границей должна быть обставлена строжайшей тайной и агентура должна быть так организована, чтобы арест или измена одного агента не влекли за собою провала всей организации. Количество агентов должно быть достаточно велико, чтобы путем многочисленных засечек иметь возможность проверить правдоподобность донесений агентов. Агенты должны быть: а) посажены на места задолго до открытия военных действий противником, б) успеть сделаться своими людьми в районе порученного их наблюдению пункта, в) надежным образом связываться со своим руководителем… Таким образом серьезность и важность тайной военной разведки, на основании изложенных выше принципов, сознавались руководителями Отделения с первых дней его функционирования, и если до сего времени в этой области не достигнуто хороших и даже удовлетворительных результатов, то причины этому приводятся ниже.