Созданный Бендукидзе Knowledge Fund приобрел тбилисскую European School of Management (ESM). В декабре на базе ESM и тбилисского Института Азии и Африки был создан Свободный университет Тбилиси.

2008 5 января Саакашвили набрал 53,5 % голосов и второй раз стал президентом Грузии. 31 января Бендукидзе возглавил государственную канцелярию правительства Грузии.

Пятидневная российско-грузинская война в августе закончилась российской оккупацией Абхазии и Южной Осетии. 27 октября Гургенидзе ушел в отставку.

2009 6 февраля новым премьером Грузии стал Ника Гилаури, 9-го Бендукидзе ушел с госслужбы.

2011 Knowledge Fund купил у государства Аграрный университет в Тбилиси.

Парламент Грузии принял Акт экономической свободы, ограничивающий пределы государственного дефицита и усложняющий введение новых налогов. Первая версия документа была подготовлена осенью 2009 года Бендукидзе, его «правой рукой» Вато Лежавой и экс-премьером Ладо Гургенидзе.

2012 Победу на парламентских выборах одержал радикально оппозиционный блок «Грузинская мечта», премьер-министром стал главный спонсор «Мечты» миллиардер Бидзина Иванишвили. Умерла мать Бендукидзе, Джульетта Рухадзе.

2013 Новые грузинские власти арестовали одного из ключевых членов команды Саакашвили – экс-министра внутренних дел и премьер-министра Вано Мерабишвили. В январе 2014 года по итогам двух судебных процессов он был осужден на девять с половиной лет лишения свободы. В начале весны министерство образования предприняло попытку заблокировать деятельность Аграрного университета, отняв у него аккредитацию (вскоре она была восстановлена).

2014 После победы Майдана Бендукидзе начал регулярно бывать в Украине, консультируя министров переходного правительства. В июле покинул Грузию, опасаясь ареста. 13 ноября умер в лондонской гостинице. Диагноз – сердечная недостаточность.