К сожалению, криминальная обстановка в стране после амнистии значительно осложнилась, хотя все рецидивисты-уголовники должны были, вроде бы, остаться за решёткой. Всю вину за случившиеся безобразия и преступления возложили в дальнейшем на инициатора милосердной акции, будто бы он преднамеренно выпустил на волю бандитов и убийц. Вовсе не в оправдание, а для сведения отметим, что, вообще-то, все амнистии сопровождаются увеличением уголовных преступлений.

Министр внутренних дел Берия решил разобраться в тех беззакониях, которые творились в последние годы при ведении следственных дел в системе госбезопасности. С этой целью своим совершенно секретным приказом № 1 от 13 марта 1953 года он создал следственные группы из новых сотрудников МВД, которым в двухнедельный срок поручил пересмотреть имевшиеся материалы по делу арестованных врачей, по делу арестованных бывших сотрудников МГБ, по делу арестованных бывших сотрудников Главного артиллерийского управления военного министерства и по делу арестованных МГБ Грузинской ССР группы местных работников.

Приказом № 2 от того же числа министр создал комиссию по рассмотрению дел о выселении по постановлению Особого совещания граждан СССР из Грузии. Тогда в МВД СССР поступали многочисленные жалобы «на неправильные действия МГБ Грузинской ССР», выразившиеся в незаконной отправке в 1951 году на спецпоселение в Казахстан большого числа лиц.

Приказом от 18 марта 1953 года Берия поручил начальнику Следственной части по особо важным делам организовать тщательную проверку дела по обвинению бывших работников ВВС Советской Армии и Минавиапрома. Следствие по этому вопросу, проведенное бывшим Главным управлением контрразведки «Смерш» Министерства вооружённых сил, выглядело «необъективно и поверхностно». В результате оказались реабилитированы военачальники маршалы авиации А.А. Новиков, С.А. Худяков, Г.А. Ворожейкин, адмиралы В.А. Алфузов, Г.А. Степанов, посмертно адмирал Л.М. Галлер, генерал-полковник В.И. Годров и маршал артиллерии Н.Д. Яковлев [Л.49].

Заметим здесь, что вопрос о пересмотре или о каком-либо дополнительном исследовании «ленинградского дела» официально, в приказном порядке не ставился.

4 апреля 1953 года в газете «Известия» было опубликовано безо всяких комментариев сообщение МВД о том, что дело врачей-убийц было провокационно состряпано «бывшим руководством бывшего МГБ» и что врачи неповинны ни в каких преступлениях. Видных деятелей медицинской науки полностью реабилитировали. Однако поскольку фамилии бывшего руководства не указывались, то осталось неясным, кто именно обвинялся в фальсификации дела. Если предпоследний министр госбезопасности В.С. Абакумов, при котором на врачей были получены лишь первые показания, сидел в тюрьме за «ленинградское дело», то занимавший пост министра последним С.Д. Игнатьев, в период своего правления, несомненно, находившийся в курсе данного вопроса, сразу после смерти Сталина был сделан секретарем ЦК КПССС. Правда, 3 апреля 1953 года было принято решение Президиума ЦК КПСС, объявившего «дело врачей» провокационным. В связи с этим на Игнатьева возложили всю ответственность и потому сначала его освободили от обязанностей секретаря ЦК, а затем вообще вывели из состава ЦК. Основного инициатора и разработчика «дела врачей» замминистра Рюмина арестовали, но официально об этом не объявили. Старые грехи хотели списать втихую.

11 апреля 1953 года было принято постановление Совмина СССР, поручавшее министру внутренних дел пересмотреть старые дела и обеспечить возвращение безвинно репрессированных на прежние места проживания. Кроме того, Берия распорядился выпустить на свободу родственников членов руководства, арестованных и сосланных в лагеря в последние годы.

Как министр внутренних дел Берия выступил с инициативой значительно ограничить права Особого совещания при МВД СССР, однако считал, что такой внесудебный орган необходим при рассмотрении дел о контрреволюционных и других общественно опасных преступлениях, которые «по оперативным или государственным соображениям» не могли рассматриваться в обычных судах.

В соответствии с предложениями Берии было обращено внимание руководства компартий Украины, Белоруссии, Литвы и Латвии на такое «извращение ленинско-сталинской национальной политики», как слабая подготовка и выдвижение национальных кадров и практика назначения на руководящую работу преимущественно работников из других республик. В результате обсуждения докладных записок, представленных Лаврентием Павловичем, Президиум ЦК КПСС постановил, что «отныне республиканская партийная организация должна возглавляться местным товарищем, а не русским, присылаемым из Москвы». На этом основании был освобождён от обязанностей первого секретаря ЦК КП Украины Л.Г. Мельников, а на его место назначен А.И. Кириченко. В отношении Белоруссии Берия 8 июня 1953 года направил в Президиум ЦК КПСС письмо, в котором отметил, что аппарат МВД БССР и подведомственных ему областных и районных органов неудовлетворительно укомплектован руководящими оперативными работниками — белорусами по национальности. Подобное положение с использованием белорусских кадров сложилось и в республиканских, областных, районных как партийных, так и советских организациях. Среди интеллигенции, занимавшейся преподаванием в вузах и работавшей в научно-исследовательских институтах и Академии наук БССР, белорусы составляли едва половину. В связи с этим Берия своей властью принял решение освободить от должности министра внутренних дел республики М.И. Баскакова и назначил на эту должность белоруса М.Ф. Дечко. Кроме того, как член Президиума ЦК КПСС Берия предложил заменить первого секретаря ЦК КП Белоруссии Н.С. Патоличева на М.В. Зимя-нина — белоруса по национальности, до недавнего времени работавшего вторым секретарем ЦК КПБ [Л.49].

Освободившись от сталинского влияния, Берия заявил о себе как о сильной личности, способной взять на себя инициативу по проведению в стране крайне необходимых кардинальных преобразований. В отличие от других высших руководителей он решил не разговоры разговаривать, а, сообразуясь с обстановкой, смело разрабатывать и предлагать на коллективное обсуждение в президиумах ЦК, Совмина и Верховного Совета СССР конкретные мероприятия по перестройке хозяйственного механизма страны. Разработанные по инициативе Берии письма, записки и распоряжения свидетельствуют о масштабности его взглядов и грандиозности собственных планов по реорганизации экономики и освобождению правоохранительных структур от несвойственных им функций. Видно и стремление руководителя существенным образом реорганизовать прежнюю систему ГУЛАГа. Предлагавшиеся Берией преобразования позволяют судить о глубокой заинтересованности энергичного администратора в решении стоявших перед страной задач, знании им реального положения дел в различных областях экономики и общественной жизни. Вместе с тем надо отметить, что нетронутым во всех этих делах остался вопрос о так называемых особо опасных государственных преступниках (шпионах, диверсантах, террористах, троцкистах, эсерах, националистах и других политических заключённых), коих в особых лагерях МВД находилось тогда 221 435 человек.

Гибельным для Берия явилось то, что он начал бороться с партийным засильем во всех областях хозяйственной жизни страны. В связи с этим при слиянии аппаратов МВД и МГБ им были удалены почти все сотрудники, прибывшие в эти ведомства из партийных органов. Берия в перспективе намерен был разрушить прежний порядок назначения на руководящие посты работников по согласованию и утверждению их кандидатур в ЦК КПСС, обкомах, горкомах и райкомах. За своих выдвиженцев отвечать должен был непосредственный начальник.