Помимо округов и объединений, МиГ-27 имелись в частях центрального подчинения. Липецкий 4-й ЦБП и ПЛС в 760-м ииапиб имел два десятка МиГ-27 в двух эскадрильях, занимавшихся не только подготовкой лётчиков, но и исследованиями по тактике и вопросам боевого применения ИБА. Одну эскадрилью на МиГ-27 имел и 281-й иапиб из 796-го Центра подготовки в Тоцком (Приволжский округ), также специализированного по ИБА. В лётных училищах число МиГ-27 было небольшим, и использовались они только в качестве наглядных пособий для курсантов — считалось, что лётчики без проблем могут освоить машину прямо в строю, пройдя обучение в училищах на МиГ-23 и стажировку в Липецке.

Осмотр МиГ-27Д из состава 296-го апиб после посадки, Гроссенхайн, июль 1991 г.

Фрунзенское авиационное училище (5-е Центральные курсы подготовки и усовершенствования авиационных кадров), специализированное на обучении авиаторов дружественных стран, продолжало готовить их на МиГ-23БН, поставки которых на экспорт продолжались до 1985 г. Исключением были индийские лётчики и техники, обучавшиеся на МиГ-27М. Их лётный состав проходил подготовку на базе 715-го уап в Луговой, техники — в Липецке.

Особо следует отметить работу МиГ-27 испытательных авиаполков, занятых по тематике расширения боевых возможностей, испытания новых видов вооружения, оборудования, отработки тактических приёмов и методик. На аэродроме в Ахтубинске, где базировались два испытательных полка НИИ ВВС, и полигонах, объединённых в 929-й ГЛИЦ, к 1985 г. были заняты 22 600 человек. Люди и машины здесь работали буквально без отдыха, полёты шли днём и ночью, и бетонка не успевала остыть — взлёт следовал за взлётом с минутными интервалами так, что за вырулившим на исполнительный старт самолётом уже нетерпеливо выстраивались следующие, увешанные ракетами и бомбами. Результаты работы можно было наблюдать прямо со стоянок — разбросанные в степи мишенные поля начинались прямо за полосой, где то и дело разгружались самолёты.

МиГ-27Д 19-го гв. апиб на аэродроме Лерц перед вылетом в Россию, 23 марта 1993 г.

На МиГ-27 НИИ ВВС за всё время его эксплуатации проводились работы по разнообразной тематике, имевшие целью повышение его боевой эффективности. Среди них были и испытания «афганских» доработок и методик боевого применения, проведённые в 1986 г. на паре машин, «одолженных» из 911-го апиб.

Политические перемены, начавшиеся в ходе перестройки, затронули и ВВС. В первую очередь новые веяния коснулись Групп советских войск в Европе: в соответствии с соглашениями Стокгольмской конференции вводился контроль за проведением крупных военных учений. С сентября 1986 г., помимо предупреждения за 42 дня о начале учений с участием авиации, устанавливалось ограничение на её использование — не более 200 самолёто-вылетов за время учений.

Разрядка и мероприятия по снижению напряженности повлекли за собой изменения в дислокации и структуре авиационных объединений. В первую очередь это коснулось ударной авиации как наиболее грозной силы, способной нести и ядерное оружие. Бомбардировочные полки Су-24, которые могли поражать цели практически по всей европейской территории, стали выводить из стран Восточной Европы, заменяя их «менее агрессивными» истребителями-бомбардировщиками с меньшей досягаемостью и боевой нагрузкой. Обычно замена производилась «рокировкой»: на смену 727-му бап на Су-24М, перелетевшему из ЮГ в Канатово, с Украины в Дебрецена в июне — августе 1987 г. перебазировались МиГ-27Д 88-го апиб. Перед передислоцированием «кайры» были сданы в другие полки, а их убыль пополнили «дэшками». Вскоре в группировке на территории Венгрии, переформированной в 36-ю ВА, предприняли унификацию ИБА: соседний 1-й гв. апиб, базировавшийся в Кунмадараше, в 1989 г. сдав свои Су-17М2, также перешёл на МиГ-27Д, переданные из 722-го и 19-го гв. апиб. Базой для переподготовки послужил дебреценский 88-й полк. Факт замены «стрижей» на «утконосов» стал уникальным — ни в одном другом случае в ходе эксплуатации сходные по возможностям и назначению машины («шило на мыло») не меняли.

Технический экипаж выполняет послеполётное обслуживание МиГ-27К 266-го апиб, аэродром Степь, лето 1990 г.

Годом спустя практику «рокировки» использовали в ЗГВ. В «духе разрядки» в 1989 г. Германию покинули оба полка Су-24. 116-й гв. бап из Бранда вывели в Белоруссию, на аэродром Лида, а оттуда в 16-ю ВА прибыл 911-й апиб на МиГ-27К, вошедший в состав 105-й адиб. 497-й бап в Гроссенхайне заменили МиГ-27М и Д соседнего 296-го апиб из Альтенбурга, куда, в свою очередь, из Белоруссии перелетели истребители МиГ-29 968-го иап. Тогда же 35-й апиб в Цербсте, летавший на МиГ-23М, получил из Шяуляя МиГ-29 и лётный состав тамошнего 53-го гв. иап и вновь стал 35-м иап (тем самым 35-й полк вернулся в истребительную авиацию, откуда в 1982 г. был передан в ИБА). Лётный состав 35-го апиб был переброшен в Шяуляй, где вошёл в состав нового 53-го гв. апиб и вскоре переучился на МиГ-27К и МиГ-27Д. Технический состав полков в ходе этой рокировки оставался на своих местах.

Часть замен диктовалась условиями Договора об обычных вооруженных силах в Европе от ноября 1988 г. Под его действие попадала и авиация на пространстве от Атлантики до Урала — боевые самолёты фронтовой авиации, средние бомбардировщики Дальней авиации, истребители ПВО, учебно-боевые самолёты и боевые вертолёты. Советскому Союзу, заявившему на переговорах общее количество боевых самолётов в 6611 единиц (в том числе ВВС — 4323 единицы), предстояло сократить их число до 5150 самолётов. В составе ВВС должны было остаться 3590 боевых самолётов (в том числе 440 — учебно-боевых), в ПВО — 1560 (60 — учебно-боевых). Превышение над установленными лимитами следовало устранить путём уничтожения машин, использования их в качестве наземной учебной матчасти или мишеней, разоружения боевых самолётов для использования в учебных целях. Всего сокращению подлежало 733 самолёта ВВС и 728 — авиации ПВО. В течение отведённых 40 месяцев ВВС предстояло разделать на металл 290 машин, 208 разоружить, 160 использовать как мишени, 15 передать в училища как наглядные пособия и 36 — в музеи. Контролировать выполнение Договора должны были группы наблюдателей, выезжавшие в части и на аэродромы.

Статьи Договора, однако, оставляли возможности для манёвра, оговаривая лимиты только для европейской части СССР и стран Восточной Европы, но не затрагивали флот и Внутренние войска МВД, что позволило сохранить часть техники и сил, передававшихся в другие рода войск (таким образом несколько танковых дивизий стали соединениями береговой обороны, а МВД обзавелось бронетанковыми частями). Другим обходным манёвром стала переброска за Урал и передислокация вглубь страны, на просторах которой они «растворялись».