В результате попадания бомб и снарядов, а также от близких разрывов с 21 по 24 сентября 1941 г. корабль получил множество повреждений, которые не снизили его боеспособность. За время нахождения «Кирова» в Кронштадте его орудия главного калибра выпустили около 500 снарядов, зенитчики сбили три и повредили 12 самолетов противника.

В связи с регулярными обстрелами рейдов и гаваней Кронштадта военный совет КБФ принял решение перебазировать крупные корабли в Ленинград. В ночь с 23 на 24 сентября «Киров» перешел в Ленинград и встал к стенке завода № 194. Заводские цеха ограничивали сектора обстрела главного калибра, поэтому крейсер перевели к правому берегу Невы у 19-й линии Васильевского острова.

Крейсер «Киров» на Неве, зима 1941/42 г.

В ноябре 1941 г. в командование кораблем вступил капитан 1 ранга С.Д. Солоухин.

В связи с замерзанием Финского залива, крейсер в числе других кораблей был привлечен к обороне Ленинграда с морского направления. Из личного состава был сформирован стрелковый батальон. 18 декабря крейсеру была установлена оперативная готовность на зимний период — 6 суток, корабль должен был иметь в готовности одну башню главного калибра. 28 декабря все корабли, стоявшие на Неве и ее притоках, были сведены в группы, крейсер вошел в группу № 1а. В декабре 1941 г., когда большинство кораблей КБФ были переведены на угольное и дровяное отопление, «Киров» одним из немногих был оставлен на нефтяном отоплении. Для сохранения тепла в помещениях палуба была покрыта толстым слоем шлака, над люками и у дверей надстроек построены тамбуры.

В суровую блокадную зиму 1941/42 года экипаж совместно с рабочими завода № 189 (Балтийский завод) ремонтировал корабль, устраняя повреждения.

28 марта 1942 года немецко-фашистское командование отдало приказ о начале операции «Айсштосс» («Ледовый удар»). Оно рассчитывало уничтожить вмерзшие в лед Невы корабли комбинированным ударом осадной артиллерии и бомбардировочной авиации. Для участия в операции были выделены осадная артиллерия 18-й армии и 1-й авиакорпус.

4 апреля при массированном налете на Ленинград на крейсер было сброшено 10 бомб, из которых 9 разорвались вблизи борта, а одна попала в корабль в районе 273 шп., пробила две палубы, борт и разорвалась уже в воде.

Повреждения, полученные крейсером в результате попадания бомбы 24 апреля 1942 г.

Вышли из строя дальномеры КДП, повреждены две установки 45- и 100- мм, наружная обшивка и палубы получили значительные вмятины. При отражении налета расход зенитного боеприпаса крейсеров составил: 207 100-мм, 390 45-мм, 650 37- мм снарядов и 1500 12,7 мм патронов. В ночь на 5 апреля противником была предпринята вторая попытка нанести удар по кораблям. Но к городу смогли прорваться лишь 8 самолетов. Повреждения, полученные во время налета, устранялись личным составом с помощью завода № 189.

«Киров» ведет огонь по противнику с позиции на Неве, зима 1941/42 г.

24 апреля 1942 г. фашистская авиация нанесла третий массированный удар по кораблям, во время которого «Киров» получил прямые попадания трех авиабомб и одного 6-ти дюймового снаряда. В 14.00 три бомбы попали в район кормовой трубы. Возник пожар в отделении вспомогательных котлов и других помещениях в надстройке, начал рваться боезапас. Горевший боезапас выбрасывался за борт, причем были случаи, когда снаряды рвались в руках личного состава. В 14.46 пожар был полностью ликвидирован. Были разрушены кормовые: ходовая рубка, ходовой и сигнальный мостики. Разрушены вся средняя надстройка от 140 до 180 шп. на верхней палубе и помещения под ней на нижней (броневой) палубе. Разрушена кормовая труба с дымоходами до бронепалубы, «ноги» грот-мачты, кормовая часть катапульты, кормовая стрела, шлюпбалки, камбуз. Разбиты фундаменты шести 100 мм орудий и двух автоматов средней группы.

Требуют замены пять 100 мм орудий Б-34 и два автомата 70-К, поврежден дальномер КДП и выведен из строя 1,5 м дальномер на кормовом мостике. Разбиты все приборы торпедной стрельбы и повреждены трубы правого торпедного аппарата.

Потери личного состава составили 86 убитых и 46 раненых. Из зенитных средств на крейсере остались только по три 45- и 37- мм орудий и пулеметы.

«Киров» на Неве в годы войны.

В ночь с 24 на 25 апреля буксиры перевели «Киров» за мост Лейтенанта Шмидта к набережной Красного флота. На место крейсера поставили старое учебное судно «Свирь». На следующее утро «юнкерсы» вновь появились над бывшей стоянкой крейсера и потопили «Свирь». По приказу начальника штаба КБФ на середине Невы между мостами Лейтенанта Шмидта и Республиканским были установлены бочки, стоя на которых «Киров» мог вести огонь главным калибром. Переход на огневую позицию с помощью буксиров не должен был занимать более двух часов после поступления приказа.

Ремонт корабля занял два месяца и включал изготовление кожуха второй дымовой трубы, кормовой надстройки и ЗКП, установку новых универсальных орудий. Вместо трехногой грот-мачты поставили легкую, одинарную. Катапульту сняли, освободив место под зенитки. Зенитное вооружение крейсера было усилено: вместо шести установили восемь 100-мм орудий, вместо катапульты — три 37-мм автомата, 45-мм пушки на кормовой надстройке заменили 37-мм автоматами, число которых было доведено до 12, установили дополнительно два счетверенных 12,7-мм пулемета «Виккерс».

В конце июня 1942 г. «Киров» перевели к правому берегу Невы к Университетской набережной. В 1943 г. верхняя палуба крейсера была покрыта броневыми плитами толщиной 35 мм в два слоя. Общий вес плит составил 270 т.

Родина высоко оценила участие «Кирова» в обороне Таллина и Ленинграда.

Указом Президиума Верховного Совета СССР от 27 февраля 1943 г. «за образцовое выполнение экипажем боевых заданий командования и проявленные при этом мужество и отвагу» крейсер «Киров» первым среди надводных кораблей КБФ был награжден орденом Красного Знамени.

В июне и июле 1943 г. «Киров» выполнил две стрельбы по батареям противника.

В январе 1944 года началась операция по разгрому немецких войск под Ленинградом — событие, которого так ждали жители блокадного города, моряки Балтфлота и воины, защищавшие Ленинград.

«Киров» совместно с другими кораблями эскадры был включен во вторую артиллерийскую группу под командованием вице-адмирала Ю.Ф. Ралля (держал флаг на крейсере). Утром 19 января буксиры взломали невский лед, крейсер вышел на середину реки и стал на якорь напротив Академии художеств (Университетской набережной). Он открыл огонь, обстреливая узлы дорог, живую силу и технику в районе Копорское — Коврово — Зайцево — Телези, поддерживал наступление 42-й армии, подавляя и разрушая узлы сопротивления противника.