Добыча нефти в России сократилась с 591 миллиона тонн в 1987 году до 303 миллионов, поскольку новая идеология — прибыль, а не добыча — глубоко пустила свои корни, но вскоре после начала нового тысячелетия «Сибнефть» начала активно расширять свое производство.

По данным Министерства энергетики, в 2001 году добыча нефти заняла первое место по росту производства, увеличив свою долю на 20 %. В 2002 году производство сырой нефти выросло на 27 процентов. В дополнение к увеличению производства на старых месторождениях компания также проводила разведку и осваивала новые месторождения.

В 2000 году было запущено четыре новых месторождения, в это же время еще 3 участка находились на стадии разработки. «Сибнефть» также инвестировала значительные средства в свой нефтеперерабатывающий завод и стала вторым производителем моторного масла в России. Между тем «Сибнефть» также открыла сеть АЗС в Москве и заявила о расширении рынка в Санкт-Петербурге. Даже Эрик Краус был впечатлен. «Я никогда не рекомендовал инвесторам продавать акции «Сибнефти», — говорит он, — и сегодня это хорошая нефтяная компания, которая хорошо развивается и хорошо управляется».

Итак, Абрамович сделал свое состояние, вовремя включившись в нефтяной бизнес, его вторым крупным шагом стала покупка двух крупных алюминиевых заводов. Стратегия обеих сделок была весьма похожа, в первом случае было использовано отчаянное положение Ельцина и его потребность в наличности. В случае приобретениях алюминиевых производств он воспользовался слабой позицией продавцов на переговорах. Алюминиевый сектор был местом самых кровавых битв на поле бывших советских государственных активов, которые последовали после падения Советской власти. Подходя к столу переговоров, Абрамович был намерен закончить эту войну.

Лучанский продал свою долю Абрамовичу. После приобретения НкАЗ алюминиевый портфель Абрамовича был заполнен. В 2000 году принадлежащие «Сибнефти» Красноярский (КрАЗ), Новокузнецкий (НкАЗ) алюминиевые заводы были объединены с «Сибалом» Олега Дерипаски с целью создания «Русского Алюминия», или «РусАла». Союз этих двух гигантских алюминиевых групп считается самым большим за всю историю России. Создание холдинга, производящего не менее 70 процентов российского алюминия, — это 10 процентов мирового рынка. Доля Абрамовича составляла 3 миллиарда долларов.

В конце 2000 года Абрамович купил у Березовского крупнейший пакет акций ОРТ (49 %) за 170 миллионов долларов. Летом 2001 года Роман Аркадьевич продал акции ОРТ государственному «Сбербанку», причем, по оценке экспертов, он выступил лишь посредником в передаче пакета акций государству и не заработал на перепродаже. Весной 2001 года акционеры «Сибнефти» скупают блокирующий пакет акций компании «Аэрофлот» (26 %).

В мае 2001 года Генпрокуратура России возбуждает несколько уголовных дел в отношении руководства «Сибнефти» по запросу депутатов Госдумы на основании акта Счетной палаты о нарушениях в ходе приватизации «Сибнефти», однако уже в августе 2001 года расследование было прекращено в связи с отсутствием состава преступления.

Летом 2001 года Абрамович с состоянием в 14 миллиардов долларов впервые входит в список самых богатых людей по версии журнала «Forbes».

В октябре 2001 года становится официально известно о создании акционерами «Сибнефти» компании «Millhouse Capital», зарегистрированной в Лондоне и получившей в управление все их активы. Председателем совета директоров «Millhouse» становится президент «Сибнефти» Швидлер.

В декабре 2002 года «Сибнефть» совместно с ТНК приобретают на аукционе 74,95 % акций российско-белорусской компании «Славнефть» (ранее «Сибнефть» выкупила у Белоруссии еще 10 % акций) и впоследствии делят между собой ее активы.

Начиная со второй половины 2003 года компания «Сибнефть» подвергалась проверкам Генпрокуратуры в отношении законности приобретения в декабре 1995 года пакета акций ряда компаний — «Ноябрьскнефтегазгеофизики», «Ноябрьскнефтегаза», Омского НПЗ и «Омскнефтепродукта», а в марте 2004 года Министерство по налогам и сборам предъявило «Сибнефти» налоговые претензии за 2000/01 год в размере около одного миллиарда долларов. Позднее стало известно, что размеры налоговой задолженности были снижены налоговыми органами более чем втрое, а сама задолженность была уже возвращена в бюджет.

В 2003 году произошла еще одна попытка слияния «Сибнефти» и компании «ЮКОС», которая срывается по инициативе Абрамовича после ареста Ходорковского и предъявления «ЮКОСу» многомиллиардных налоговых претензий.

В июле 2003 года компания «Millhouse Capital» объявила о приобретении у известного международного производителя и продавца лекарств ICN Pharmaceuticals Inc. всех его российских активов. Сумма сделки составила 55 миллионов долларов. Тогда Абрамовичу, интересы которого представляла инвестиционная компания «Профит Хаус», удалось опередить остальных участников тендера, предложив за «ICN Россия» на 5 млн больше, чем конкуренты. В распоряжении «Millhouse Capital» оказались пять промышленных предприятий: «Октябрь» (Санкт-Петербург), «Лексредства» (Курск), «Полифарм» (Челябинск), «Марбиофарм» (Йошкар-Ола), «Томскхимфарм» (Томск), сеть из 96 аптек и аптечных киосков по всей стране, московский офис ICN площадью 12 000 кв. м. и все товарные знаки, принадлежавшие «ICN Россия». В этом же году приобретенные фармацевтические активы были переданы для управления группе «Биовит», которая уже владела производственными мощностями в Уфе и Нижнем Новгороде. Сразу же провели реструктуризацию, в результате которой было принято решение о продаже аптек и сети распространения. На челябинском «Полифарме» было свернуто производство, и все оборудование переправили на курское предприятие «Лексредства». Такая же участь в 2006 году постигла и санкт-петербургский «Октябрь». В течение 2003–2005 гг. Абрамович продал свои пакеты акций «Аэрофлота», «Русского алюминия», «Иркутскэнерго», Красноярской ГЭС, «РусПромАвто» — и, наконец, в октябре 2005 года продал свой пакет акций (75,7 %) компании «Сибнефть» «Газпрому» за 13,1 миллиарда долларов.

ОАО «НК ЮКОС» — российская нефтяная компания, существовавшая с 1993 года. О ее банкротстве было объявлено1 августа 2007 года

В июне 2006 года компания Романа Абрамовича «Millhouse Capital» выкупила через сеть офшоров у Александра Абрамова и Александра Фролова 41,3 % акций крупнейшей металлургической корпорации России «Evraz Group». Сумма сделки не называлась, но эксперты оценили это приобретение в 3–3,5 миллиарда долларов, а капитализацию всей «Евраз Групп» — в 8,5–9 миллиардов долларов. «Евраз Групп» включает в себя Нижнетагильский, Западно-Сибирский и Новокузнецкий металлургические комбинаты, итальянский «Palini e Bertoli» и чешский «Vitkovice Steel», а также горнодобывающий бизнес, в который входят «Евразруда», Качканарский и Высокогорский ГОКи, «Нерюнгриуголь».

В марте 2007 года Роман Абрамович развелся со второй женой Ириной. По утверждению британской прессы, отношения между супругами окончательно испортились после того, как появились слухи о связи Абрамовича с Дарьей Жуковой, бывшей подругой теннисиста Марата Сафина. Раздел имущества не затронул деловых интересов самого богатого россиянина. По данным британской прессы, Роман Абрамович выплатил рекордную сумму компенсации своей супруге, бывшей с ним на протяжении 15 лет, а также обязался содержать пятерых детей. Ирина воспользовалась услугами знаменитого адвоката Реймонда Туза, который за свои успехи на поприще бракоразводных процессов удостоился прозвища «Челюсти».