Соответствующие задачи получила и 10-я авиабригада КБФ генерал-майора Н.Т. Петрухина, которой в первый день операции следовало вылететь в 2.55 и в 3.20 нанести удар по восточной береговой батарее на мысе Сууроп. В 3.00 следовало нанести удар по острову Найссаар, а в 3.10 – удар по западной батарее на мысе Сууроп. В течение дня бригада должна была наносить повторные удары по береговой артиллерии, барражировать над Таллином и вдоль эстонского берега до залива Хара-Лахт с целью блокады воздушного пространства и разведки моря[1076].

Однако 15 июня в план боевых действий ОАГ были внесены изменения, согласно которым 35-му скоростному бомбардировочному авиаполку в 3.00, а 38-му истребительному авиаполку в 2.55–3.05 следовало нанести удар по береговой артиллерии на острове Аэгна. 52-й скоростной бомбардировочный авиаполк теперь должен был вместо удара по аэродрому в Пярну в 3.10 атаковать береговую артиллерию на острове Аэгна. 53-й дальнебомбардировочный авиаполк должен был в 3.30 нанести удар по береговым батареям на мысе Сууроп. Задачи остальных авиасоединений оставались прежними[1077]. Так же был уточнен и план боевых действий 10-й авиабригады КБФ, которой теперь следовало в 1.30–1.40 нанести удар по береговым батареям на мысе Сууроп, а в 6.00 – по батарее на острове Вимси и одновременно поддержать высадку морского десанта на остров Найссаар. В 12.00 бригада должна была поддержать высадку морского десанта на остров Аэгна[1078].

Тем временем штаб 65-го ОСК подготовил совершенно секретный план действий войск корпуса и Палдиской базы КБФ при объявлении боевой тревоги. Согласно этому документу перед войсками ставилась «общая боевая задача: 1) При оказании вооруженного сопротивления уничтожить части Таллинского гарнизона эстонской армии и вооруженных организаций “Кайтселит”.

2) Захватить гор. Таллин и обеспечить установление порядка в таковом.

3) Захватить и удерживать острова Эзель [Сааремаа], Даго [Хийумаа], Найссар, Аэгна-сар и Моон [Муху]».

5-му отдельному мото-механизированному отряду и 35-й авиабазе следовало занять район вокруг Раплы, обеспечить высадку десанта на аэродроме Куусику, вести разведку на Таллин, Пярну, Вильянди и быть готовым к действиям в северо-восточном, южном и северном направлении. 18-й танковой бригаде (без 65-го отдельного танкового батальона) ставилась задача занять Таллин и подавить встреченное сопротивление. 65-й отдельный танковый батальон подчинялся 16-й стрелковой дивизии и сосредоточивался в Клооге, откуда через Кейлу должен был продвигаться на Таллин. 16-й стрелковой дивизии ставилась задача занять Таллин, а 3-му батальону 46-го стрелкового полка следовало занять Хаапсалу и прикрыть аэродром Синалепа.

Задачи морской базы в Палдиски сводились к следующему:

«1. Блокирует эстонское побережье. Не допускает входа и выхода из портов военных и торговых судов.

2. Высадкой десанта в Таллине одного с[трелкового] б[атальона] (Минная гавань) захватывает и удерживает портовые учреждения и сооружения.

3. Подавляет береговую оборону на полуос[трове] Сурупи-аль [Сууроп], ос[тровах] Найссар и Аэгна-сар. Высаживает десанты и захватывает острова.

4. Огнем судовой артиллерии содействует сухопутным войскам по захвату Таллин и ос[тровов] Даго и Эзель.

1. С Ч + 01 м флот блокирует побережье и порты Эстонии и Финляндии.

2. Береговая и судовая артиллерия подавляет батареи береговой артиллерии на ос[тровах] Найссар, Аэгна-сар и полуос[трове] Сурупи-аль.

3. Один стр[елковый] б[атальо]н из Палдиски переходит в Тулина и поступает в подчинение к[оманди]ра 47 сп для захвата батареи на полуос[трове] Сурупи-аль». Кроме того, 2 стрелковых батальона следовало подготовить к высадке на острова Найссар и Аэгна.

Особая авиагруппа должна была наносить удар по военным объектам в районе Таллина, прервать железную дорогу Раквере – Таллин, не допускать сосредоточения противника, содействовать своим войскам и прикрывать их с воздуха. Если приказ на введение плана в действие поступит в 00 часов, то действия авиации следовало начать с 3.30. 11-му отдельному зенитному артдивизиону следовало прикрывать штабы и аэродромы в Синалепа и Клоога. Развернутый на острове Хийумаа 3-й батальон 47-го стрелкового полка должен был занять остров, а гарнизону на острове Сааремаа в составе 48-го стрелкового полка, 16-го артполка и роты танков следовало занять его и соседний остров Муху для связи с материком. «Штаб корпуса к утру 13.6 первым эшелоном располагается в Палдиски, в дальнейшем переходит в Клоога. Штаб 16 сд, штаб авиагруппы к вечеру 12.6 переходит в Клоога». Боевую тревогу следовало объявлять по сигналу «Гудок» или передачи по радио в течение 2 минут позывного «33333». Для сообщения о приеме данного сигнала по радио устанавливался ответный позывной «11111»[1079]. С 21.30 14 июня радиостанции дислоцированных в Прибалтике советских войск должны были работать только на прием, ожидая условного сигнала о начале операции. В любом случае действия по плану операции должны были быть начаты «только по получении сигнала и в указанное время»[1080].

Пока продолжалась детальная разработка плана операции, начались конкретные советские военные приготовления на границах Эстонии, Латвии и Литвы. Вероятно, впервые эти мероприятия обсуждались с 21.05 до 22.35 1 июня в кабинете И.В. Сталина с участием члена Политбюро ЦК ВКП(б) председателя Комитета обороны при СНК СССР маршала К.Е. Ворошилова, наркома обороны маршала С.К. Тимошенко, его заместителей начальника Политуправления РККА армейского комиссара 1-го ранга Л.З. Мехлиса, начальника Управления по командному и начальствующему составу РККА армейского комиссара 1-го ранга Е.А. Щаденко и начальника Артиллерийского управления маршала Г.И. Кулика, а также начальника Генштаба маршала Б.М. Шапошникова, начальника Автобронетанкового управления командарма 2-го ранга Д.Г. Павлова и начальника Управления ВВС командарма 2-го ранга Я.В. Смушкевича[1081]. 3 июня нарком обороны издал приказ № 0028, согласно которому следовало «в целях объединения руководства войсками все войсковые части Красной Армии, размещенные на территории Эстонской, Латвийской и Литовской Республик, с 5 июня 1940 г. из состава Ленинградского, Калининского и Белорусского военных округов исключить. Все эти части переходят в мое непосредственное подчинение, через Зам[естителя] Народного Комиссара Обороны Командарма 2 ранга тов. Локтионова А.Д.»[1082]. В тот же день был издан Указ Президиума Верховного Совета СССР, согласно которому «в связи со сложной международной обстановкой» предписывалось «задержать в рядах Красной Армии красноармейцев 3-го года службы до 1 января 1941 г.» и «до особого распоряжения призванный… командный и начальствующий состав запаса»[1083].