Лодка подвешивалась под фюзеляжем кормой вперед. Для сброса использовался механический привод, включавшийся с места бомбардира. Лодка падала носом вперед под углом 50гр. От быстрого разгона лодку предохранял парашют диаметром 30.48 м.

Самолеты SB-29 использовались поисково-спасательной службой в 1947-55 гг. Их применяли во время Корейской войны для поиска экипажей сбитых над морем В-29. Для ночною поиска под крыльями самолеты SB-29 оборудовались ракетницами, стрелявшими пусковыми ракетами.

В-29 « The Big Slink» из 509-й группы. Позднее этот самолет, уже под названием «Dave's Dream» сбросит 1 июля 1946 года на атолл Бикини атомную бомбу.

B-29-96-BW «The Еуе» во время испытаний на атолле Бикини служил в качестве транспортного самолета, доставив наблюдателей в район испытаний.

В-29 «Reserved» из 98-й группы. Йокота, Япония, конец 1951 года. Нижняя сторона самолета выкрашена блестящей черной краской – ночной камуфляж.

В-29 «Тор of the Mark» из 28-й эскадрильи, Кадена, Окинава, осень 1950 года. На носу более 40 отметок о боевых вылетах. 19-я бомбардировочная группа называюсь «личным авиаотрядом Макартура». Эта часть первой приступила к боевым вылетам в ходе Корейской войны.

Самолеты В-29, модифицированные для проведения метеоразведки, получили обозначение WB-29. Вооружение на них отсутствовало, все турели демонтированы, а отверстия для них в фюзеляже закрыты заглушками. Перед местом передней верхней турели установили астро-навигационную башенку. Экипаж 10 человек: двое пилотов, бортмеханика, наблюдателя-метеоролога, штурмана, радиста, левого наблюдателя (оператора сбрасываемого зонда), оператора радиозонда, правого наблюдателя. На некоторых самолетах еще один наблюдатель помещался в хвостовой установке.

Самолет WB-29 оснащался большим количеством метеорологической аппаратуры, в том числе психрометром ML-313/AM, измерителем удельной влажности ID/AMQ-2, радиоальтиметр SCR-718, радар-альтиметр AN/APN-1 и радиозонд AN/АМТ-3, сбрасываемый на парашюте. Самолеты WВ-29 использовались для взятия проб воздуха после наземных испытаний авиабомб. При этом самолет оснащался дополнительным воздушным фильтром на месте верхней задней турели.

Самолеты WB-29 применялись ВВС США до марта 1960 года.

Один B-29-96-BW (45-21800) выпустили под обозначением ЕВ-29 и использовали в программе развития самолетов с ракетными двигателями. С самолета сняли крышки бомбового отсека. Под фюзеляжем смонтировали специальную платформу для подвески самолета, а так-же дренажи аварийного сброса ракетного топлива. Самолет ЕВ-29 участвовал в испытаниях самолетов-ракет Х-1, Х-2А, Х-2В, Х-1С, Х-ГО, Х-1Е. 14 октября 1947 года ЕВ-29 поднял в воздух ракетоплан Х-1. Управлял самолет экипаж Чарльза Йегера. После отделения от самолета ракетоплан преодолел звуковой барьер.

Другим самолетом-носителем, обозначенным ЕВ-29, стал В-29-60-ВА (44-48111). Этот самолет применялся для испытаний экспериментальных истребителей «Макдоннелл ХР-85 Гоблин». Предполагалось использовать эти истребители в качестве носимых истребителей, подвешиваемых к стратегическим бомбардировщикам В-36 «Конвейр» и сбрасываемых в районе цели для прикрытия бом-бардировщиков во время бомбометания. По завершению операции истребители могли снова вернуться на бомбардировщики благодаря специальному механизму подвески. ЕВ-29 нес ХР-85 в заднем бомбовом отсеке, с которого сняли крышки. Внутри смонтировали специальную раскладную конструкцию, предназначенную для выведения истребителя из бомбоотсека и перехвата его при возвращении.

В-29 «Fire Ball» из 98-й группы. Самолет первым вылетел с базы Фейрчайлд в Йокоту. На новой базе группа оставалась до июня 1952 года.

Идет регулировка двигателя R-5350 на В-29 «Mule Train» из 22-й группы, Кадена. 22-я группа перебазировалась в Кадену в июле 1950 года, вместе с тремя другими группами, направленными для службы в Корее

После 1954 года часть снятых с вооружения В-29 переделали в дистанционно управляемые самолеты-цели. Им присвоили обозначение QB-29.

В-29, предназначенные для дистанционного управления самолетами-целями, обозначались DB-29.

В 1949 году один B-29-BW переделали в транспортный самолет, обозначив его СВ-29K. Самолет летал до 1956 года.

Один В-29 использовался командованием стратегической авиации в качестве пассажирского, для перевозки особо важных персон. Самолету присвоили обозначение VB-29.

14 апреля 1947 года ВМФ США получила из резерва ВВС США четыре В- 29-BW (45-21789. 45-21797, 45-21791, 44- 87766). Самолетам присвоили серийные номера морской авиации (BuNo 84028, 84029, 84030. 84031). В соответствии с принятой на флоте системой обозначений, самолеты стали называться P2B-1S. Бомбардировщики применялись для испытания новых систем вооружения и поиска подводных лодок. P2B-1S (BuNo 84029) использовался в качестве носителя экспериментального ракетного самолета «Дуглас D-558-2 Скайрокст». После завершения испытаний самолет передали в NACA. Два самолета оснастили дополнительными бензобаками в бомбовых отсеках и радиолокаторами, присвоив машинам обозначение P2B-2S.

В начале 50-х годов ВВС США приступило к работам над авиационными системами раннего оповещения (airborne early warning). В июле 1951 года три В-29 приспособили для испытаний систем подобного рода. Самолет B-29-80-BW (44-87599) оснастили радаром AN/APC-20C с антенной под массивным диэлектрическим обтекателем каплевидной формы, установленным над передней частью фюзеляжа.

В-29, использовавшиеся для испытаний различной электроаппаратуры, обозначались как ERB-29.