Еще в марте 1944 года был переработан предварительный проект от 26 августа 1943 года, в соответствии с которым предлагались два базовых варианта, которые должны были стать образцами для будущих вариантов серии Ar-234В. Ar-234 С-1 должен был быть разведывательным самолетом, оснащенным двумя камерами в задней части фюзеляжа, а также имеющим возможность подвески под гондолами двигателей дополнительных топливных баков емкостью по 300 л. Под фюзеляжем планировалось подвешивать контейнер, в котором устанавливались две пушки MG 151/20 калибра 20 мм, стреляющие назад. Бомбардировочный вариант – Ar-234 С-2 мог переносить под фюзеляжем и мотогондолами 1500 кг бомб. Вместо камер, в задней части фюзеляжа, устанавливались две стреляющие назад пушки MG 151/20 калибра 20 мм. Две такие же пушки, стреляющие вперед, были расположены в нижней части кабины пилота. Оба варианта имели фонарь кабины новой формы.

16 мая 1944 года представителям RLM был продемонстрирован макет версии «С». Комиссия утвердила предварительный проект, приказав однако перекомпоновать кабину пилота. В связи с этим фирма «Арадо» отказалась от развития версий С-1 и С-2, в пользу следующих модификаций: бомбовой Ar-234 С-3, и разведывательной Ar-234 С- 4, с вооружением, уменьшенным до передней пары пушек MG 151 /20 калибра 20 мм. Оба самолета походили на предшественников, но имели новую, герметичную кабину с существенно поднятым вверх остеклением, благодаря чему несколько улучшился обзор назад. Это было многократно повторяемое пилотами замечание, которые утверждали, что отсутствие непосредственного обзора назад является самым большим недостатком Ar-234, который не коей мере не компенсирует установленный перископ. Ar-234 С-3 должен был оснащаться стрелковым прицелом PV1B, а также бомбовыми прицелами BZA1C и Lotfe 7k. Под фюзеляжем устанавливался пилон Schloss-2002 или ЕТС-2000, а под гондолами двигателей – ЕТС-504. Последний крепился между двумя гондолами двигателей BMW 003, но не к самим гондолам, а к конструкционным узлам крыла. Это было возможно благодаря установки его на длинных опорах, проходящих между двигателями к верхней части гондол. Радиооборудование самолета состояло из FuG 16, FuG 25, FuG 102, FuG 136, FuG 142, FuG 217. Вооружение должно было состоять из двух пушек MG 151/20 калибра 20 мм стреляющих вперед, а также двух таких же пушек стреляющих назад. Боезапас к каждой пушке составлял 250 снарядов.

Ar-234 С-3 (W.Nr 250006), на аэродроме Мюнхен-Рейн, май 1945 года.

Карточка из заводской документации, представляющая проект Ar-234 Р-5 с четырьмя двигателями BMW- 003 А-1. Самолет должен был быть ночным истребителем. В колонке №1 таблицы перечислено вооружение истребителя – две пушки MG-151, с боезапасом по 250 снарядов (поз. 1 чертежа), две пушки установленные под наклоном (так называемая установка «Schrage Мusiк»), пушка МК-108 с боезапасом в 100 снарядов (поз.2), а также прицелы и два бомбодержателя ЕТС 501 (по одному под каждой парой двигателей). В колонке №2 перечислено электронное оборудование самолета, а в колонке №3 – бронирование. Под поз. 4 приведен максимальный запас топлива, которое мог брать самолет.

Первым прототипом, в котором использовалось большинство элементов характерных для версии «С» был Ar-234 V19 (PI+WX, W.Nr 130029). Его силовая установка состояла из четырех двигателей BMW 003А в несколько перепроектированных двойных гондолах. Самолет не вооружался пушками MG 151/20. Машина впервые поднялась в воздух 16 октября 1944 года, под управлением Уббо Нансена. После серии испытаний машина была передана в исследовательское подразделение фирмы BMW, которое в январе 1945 года было переведено из Ораниебурга в Магдебург.

Ar-234 V19 доставил специалистам из Бурга большое количество проблем. Они в основном касались двигателей и установленных на них «стартеров Riedel». Характеристики самолета были оценены как «отличные», однако его возможности снижал фюзеляж. Оказалось, что горизонтальный полет с максимальной скоростью невозможен, так как хвост самолета начинал вибрировать. Считалось, что Ar-234С имеет избыток тяги, а расчетная максимальная скорость на уровне 800-850 км/час была слишком высока. При полетах с использованием полной тяги двигателей управление становилось очень трудным. Появлялись проблемы подобные тем, что проявились во время испытаний Ме-262. Связано это было с приближением к звуковому барьеру. В январе 1945 года программа испытаний была завершена, а самолет в дальнейшем планировалось использовать для испытаний стреловидных крыльев по программе «Veruchflugel II».

Последний перелет Ar-234 V19 произошел в апреле 1945 года. В этот день, в 8.00 в Бурге ожидался налет союзнической авиации. В такой ситуации пилот решил стартовать двумя часами ранее, отдавая себе, отчет о проблемах которые были связаны с двигателем №4, а также указателем уровня топлива. На трех работающих BMW 003 без особых проблем самолет взлетел и достиг Монатих-Обервесенфельда. На следующий день уже с использованием четырех двигателей, а также дополнительных стартовых ускорителей Walter 109 500, самолет стартовал с короткой (1300 м) травяной полосы в Фюрстенфелдбрюк (Furstenfeldbruck). К сожалению эта авиационная база была разбомблена и большинство находящихся там самолетов было уничтожено, но Ar-234 V19, который стоял в некотором отдалении от взлетно-посадочной полосы, остался неповрежденным. Спустя несколько дней, после необходимого ремонта взлетной полосы, самолет вылетел в Нюрнберг, где присоединился к Ar-234 VI4. Через пару дней, из-за приближения неприятельских войск, Ar-234 V19 был взорван в лесу Хофолдингер (Hofoldinger).

Уже 5 ноября 1944 года к Ar-234 V19 присоединился практически идентичный ему Ar-234 VI9 (PI+WY, W.Nr 130030). Во время первого полета за его штурвалом сидел Йансен. Этот самолет не летал слишком долго – тремя днями позже руливший по полосе истребитель FW-190 таранил стоявший невдалеке прототип. Йансен находившийся в этот момент в кабине Ar-234 V20, получил легкое ранение. Только в январе 1945 года самолет был отремонтирован и мог продолжить испытательные полеты. Теперь на нем проводились всякого рода испытания шасси, а после перегона в Рехлин – пробы стартов в перетяжеленной конфигурации. Вскоре самолет возвратился в исследовательское подразделение фирмы «Арадо». Но когда к нему начали приближаться советские войска , Ar-234 V 20 был эвакуирован, сначала на аэродром Бранденбург-Брест, а затем в Весендорф, куда попал вместе с одним из подразделений исследовательского отдела, скрытого под кодовым названием Heidfahrten GmbH. Здесь он был сильно поврежден во время налета союзнических бомбардировщиков 4 апреля 1945 года. Вместе с ним был уничтожен и Ar-234 VI2.

Третьим прототипом серии «С» был Ar-234 V21 (PI+WZ, в тот период когда на нем летал Йансен, или RK+EK – когда летал Эйхем, W.Nr 130061) оснащенный четырьмя двигателями BMW 003А-1. Этот самолет был одновременно и первым образцовым экземпляром Ar-234 С-3, хотя и не имел перископа. Первый полет эта машина совершила 24 ноября 1944 года, под управлением Йансена. Ar-234 V 21 имел кабину, которая предусматривалась для серийных машин, а также комплект вооружения, из двух стреляющих вперед пушек MG 151/20 (размещенных в нижней части кабины пилота), и двух таких же пушек стреляющих назад (размещенных в задней части фюзеляжа). Вероятнее всего это был единственный экземпляр Ar-234 С, который имел обе пары пушек. Даже построенные Ar-234 С-3 вооружались только передней парой пушек, несмотря на имевшиеся лафеты для задних MG 151/20. После испытания вооружения, прототип Ar-234 V21 был передан на испытания оборудования. Испытания завершились в конце января, после чего самолет должен был быть переделан получив стреловидные крылья ламинарного профиля – «Veruchflugel IV». Решение предать его для проведения этой программы было принято 30 апреля 1945 года, а окончание работ по его переделке планировалось на 31 мая 1945 года. Несложно понять, что из этих планов ничего не вышло.