Экипаж "Фусо" состоял из 31 офицера и 320 нижних чинов. На часть строевой команды имелось 177 ружей системы Мартина и 80 револьверов Смит-Вессона. За время службы корабля штатная численность его экипажа менялась и составляла, по данным разных источников, от 250 до 386 человек. По отзывам современников, "офицерские каюты, кубрики для команды, помещения для сухой и мокрой провизии, парусов, канатов, шкиперского имущества, арсенала для минных принадлежностей располагались удобно, были просторны и хорошо вентилировались". Среди наблюдающих за ходом постройки фрегата был молодой офицер по фамилии Того, который в это время служил в качестве стажёра в Королевском военно-морском флоте Британии и через тридцать лет стал героем Японии.

В январе 1878 г. корабль построили, а в феврале, когда "Фусо" начал свой путь из Англии в Японию, Того стал одним из офицеров броненосца. По приходу домой его перевели на другое место службы, но вскоре он вернулся на корабль и дослужился на нем от младшего лейтенанта до лейтенанта.

Незадолго до войны с Китаем, в 1895 г., "Фусо" поставили в завод для капитального ремонта и перевооружения, во время которых на нем изменили оснастку барка. Его грот- мачту демонтировали, а фок и бизань оборудовали боевыми марсами для малокалиберных скорострельных 37-мм пушек и пулеметов.

Два устаревших 168-мм орудия заменили на два 152-мм 40-калиберных. Они оказались тяжелее (на 1,63 т каждое), но их скорострельность и баллистические характеристики были значительно выше. В дополнение корабль оснастили четырьмя лёгкими пушками и шестью пулемётами. Изменение артиллерийского вооружения провели сразу и после войны с Китаем: две 152-мм 40-калиберные скорострельные пушки со щитами, так хорошо себя зарекомендовавшие в боевой обстановке, смонтировали одну на баке и одну на юте.

Вскоре и 240-мм казематные орудия, признанные к тому времени непригодными для боевого применения, заменили на четыре скорострельные 152-мм. Но, по данным справочника Брассея, в 1898 г. фрегат еще продолжал сохранять свои 240-мм орудия. Получается, что "Фусо" имел на вооружении восемь 152-мм и семь малокалиберных орудий, два торпедных аппарата после 1899 г. По отечественным же данным, броненосец проходил капитальный ремонт в 1898 г., после аварии у о. Сикоку, когда, вероятнее всего, на нем сменили орудия. Его водоизмещение тогда увеличилось до 3770 т.

Во время войны с Китаем "Фусо" применил свою артиллерию по реальному противнику в первый и последний раз. Всю войну капитан 1 ранга Араи командовал кораблем, входившим в состав главной эскадры в сражении при Ялу. Так как к этому времени он, прослужив уже более 18 лет, мог, вероятнее всего, развивать скорость от 10 до 11 узлов, его броня из кованого железа могла оказывать лишь незначительное сопротивление уже употреблявшимся в то время стальным снарядам, а на вооружении броненосец имел всего два современных орудия, не считая малокалиберных, то и вклад его в общую победу был скромен.

Недаром "Фусо" подвергся модернизации одним из последних японских броненосных кораблей, как наименее ценный, и возможная задержка со вводом в строй которого менее других сказывалась на общей боеготовности флота. При Ялу он занимал предпоследнее место в японской линейной колонне из десяти кораблей (впереди "Хией" и после "Хашидате"). Тихоходный, он постепенно все более отставал от колонны, рискуя попасть под сосредоточенный удар сильных броненосцев противника, хотя и продолжал вопреки этому добросовестно повторять все маневры переднего мателота.

В этом бою японские тихоходные корабли, шедшие в арьергарде, рано покинули свои места в строю, так как не могли выдержать столкновения с неприятелем на близком расстоянии и, будучи кораблями слабо защищенными и вооружёнными, были бы наверняка уничтожены. "Фусо" оказался исключением, его все- таки выручали броня и везение. У китайцев, по причине меньшей скорости, практически не было шансов таранить корабли летучего отряда или навязать им свою волю. Но в колонне главной эскадры к концу боя один такой тихоходный корабль оставался. Это был "Фусо". На него напасть они еще могли, но к тому времени подавляющий перевес в силах был уже на стороне противника.

В итоге "Фусо" остался лишь одним из четырёх ветеранов главной эскадры, успешно завершившим все из японских боевых манёвров и не потерявшим при этом своего места в строю, и одним из тех кораблей в эскадре, которые избежали серьёзных повреждений, заняв шестое место в списке потерь личного состава. По данным Ф. Т. Джейна, правда, считается, что он получил более тяжелые повреждения. Однако такое мнение не подтверждается списком потерь, хотя, конечно, и тот может оказаться искаженным либо случайно, либо намеренно. Вероятнее всего, если японцы и занизили число своих потерь, то равномерно по всей эскадре.

Количество выведенных из строя членов экипажа "Фусо" по разным источникам не совпадает: двое убитых и двенадцать раненых или один офицер и четыре матроса убитыми и один офицер и шесть матросов ранеными. Главное, после сражения фрегат остался в строю и продолжал сражаться в составе эскадры всю войну. Данных о потерях и повреждениях корабля в других боях этой войны не имеется. Факт получения кораблем ущерба во время захвата Вей Ха Вея не подтверждается.

Судьба отвернулась от "Фусо" уже после войны, 29 ноября 1897 г., когда его сильным ветром сорвало с якоря неподалеку от о. Сикоку и после дрейфа его протаранил крейсер "Мацусима", чем еще раз подтвердил опасность тарана в первую очередь для своих кораблей. Вероятно, крейсер пытался оказать помощь дрейфующему кораблю, который, видимо, не мог сразу дать ход, но неудачно сманеврировал. Угроза затопления от поступающей через пробоину воды, с которой не справлялись водоотливные средства, на момент постройки считавшиеся избыточными, вынудила командира направить броненосец к берегу, на риф около Ниихамы. "Фусо" затонул, успев добраться до мелководья, но в сентябре 1898 г. (по другим данным, через два месяца) его подняли и отвели для ремонта на верфь в Куре.

Ко времени русско-японской войны он снова стал в строй, поднял вымпел и примкнул к действующему флоту. Его артиллерийское вооружение тогда состояло из двух 152-мм, четырех 120-мм 40-калиберных и одиннадцати 47-мм (3-фунтовых) орудий. Обе 152-мм пушки были смонтированы побортно в батарее под главной палубой, где первоначально размещались 240-мм крупповские и защищались 203мм броней, а 120-мм орудия стояли открыто на верхней палубе по одному на баке и на юте и два побортно в районе миделя. Торпедных аппаратов стало три, а на мачтах появилась радиоантенна.

Несмотря на недавний ремонт и серьезное перевооружение, в боевых действиях русско- японской войны "Фусо" участия не принимал и использовался исключительно как дозорный корабль у своего побережья. Он долго сохранял солидное название "броненосец", побывав и в роли корабля береговой обороны, и исполняя функции учебного судна. Лишь Турция долго держала в строю аналогичный корабль.

В 1908 г. "Фусо" стал использоваться в качестве брандвахтенного судна, пока в 1910 г. не был разоружен, прослужив в строю около 32 лет. Окончательная судьба броненосца "Фусо" неясна, вероятно, его вскоре после разоружения разобрали на металл. В 1914 г. в японском флоте появился новый корабль, его преемник линкор "Фусо".