В конце июля 1944 г. приказом наркома ВМФ расформировали Керченскую и Туапсинскую военно-морские базы, на основе которых созданы Туапсинский ОВР, а также ОВР Керченского пролива и Азовского моря. Вновь созданные соединения ОВР включили в состав Новороссийской военно-морской базы.

Таким образом, по мере расширения операционной зоны Черноморского флота основные силы флота передислоцировались на Запад и использовались для поддержания благоприятного оперативного режима, необходимого для действий легких сил и подводных лодок на фланге наступающих войск Красной Армии.

Основным содержанием повседневной боевой деятельности флота в 1944 г. стала борьба с минной опасностью. Эта борьба обеспечивалась системой дозорной службы и организацией противолодочной обороны. В течение 1944 г. минная опасность на театре непрерывно возрастала и во второй половине года фактически стала главной опасностью для плавания наших кораблей и судов. Постепенно черноморцы переносили действия своих сил в северо-западный район Черного моря, где противник поставил большое число оборонительных минных заграждений, включавших донные неконтактные мины. Противник минировал также оставляемые им порты и осуществлял постановку мин в районе наших военно-морских баз.

Для борьбы с минной опасностью штаб Черноморского флота разработал специальный план, предусматривавший траление фарватеров для входа в освобождаемые от противника порты с последующим тралением всей их акватории, разведывательное траление на подходах к захваченному противником побережью, уничтожение обнаруженных минных полей и банок, прокладку новых и расширение действующих фарватеров. В 1944 г. в составе Черноморского флота сформировали три бригады траления: 1-ю бригаду — в апреле, 2-ю — в мае и 3-ю — в июне.

До этого в составе флота подобные специализированные соединения отсутствовали. Силы существовавшей ранее бригады траления и заграждения использовались главным образом для решения задач конвойной и дозорной служб, для участия в высадке войск десантов и даже для набегов на коммуникации противника. На базе этой бригады как раз и создали 1-ю бригаду траления, непосредственно подчиненную Военному совету Черноморского флота. Она использовалась для очистки от мин подходов к Новороссийску и побережью Крыма. 2-я бригада находилась в распоряжении командира Керченской, а 3-я бригада — командира Одесской военно-морских баз. Бригадами траления протраливались подходные фарватеры, рекомендованные курсы между военно-морскими базами, а также внешние рейды портов.

В целях ускорения работ первоначально протраливались относительно узкие фарватеры, обеспечивавшиеся надежным навигационно- гидрографическим оборудованием. Ширина фарватеров, протраленных контактными тралами, обычно составляла 10–20 кб, а неконтактными — не более 5 кб.

Траление внутренних рейдов военно-морских баз, акватории портов и очищение от мин причальных линий проводилось силами ОВР. Качество траления надо признать высоким — до окончания военных действий ни одного крупного транспорта или боевого корабля на Черном море от подрывов на минах не потеряли. Всего произошло 27 случаев подрыва на минах (из них восемь в ходе неконтактного траления), которые относились к малым плавсредствам (сейнеры, шхуны, катера-тральщики и т. п.).

Траление фарватеров и акваторий портов производилось поочередно тралами трех систем: сначала катерным тралом, затем тралом ОТШ-2, а после этого неконтактным тралом типа КЭМТ-2. Кроме того, для уничтожения мин применялось бомбометание глубинными бомбами.

Одновременно с тралением в целях более надежной противоминной обороны кораблей и судов флота, а также обеспечения безопасности их плавания, осуществлялись: проводка кораблей за тралами, эскортирование катерами впереди по курсу в целях ПМО, поиск и уничтожение плавающих мин, плавание всех кораблей и транспортов только по рекомендованным курсам, проводка кораблей и судов военными лоцманами.

Всего в северо-западном районе Черного моря за 1944 г. вытралено 509 мин, в том числе 354 якорных гальваноударных, 155 донных неконтактных и 41 минный защитник.

Дозорная служба на Черноморском театре в 1944 г. из-за недостатка необходимых для этого сил и средств осуществлялась лишь эпизодически и, по существу, никакой роли в боевой деятельности флота не играла. Несмотря на то что обстановка, сложившаяся на театре, требовала несения ближних дозоров, даже в северо-западном районе Черного моря за весь 1944 г. в ближний дозор не выходил ни один катер или какой-либо другой корабль из состава Одесской, Николаевской и Очаковской военно-морских баз. В Туапсинской, Керченской и Новороссийской ВМБ корабли выходили в ближний дозор только до апреля 1944 г., то есть до освобождения Керченского полуострова. Однако и в этих базах дозор был слабым по своему составу и выставлялся нерегулярно.

Пытаясь как-то компенсировать отсутствие ближних дозоров, штабы военно-морских баз в зависимости от обстановки эпизодически развертывали так называемые специальные дозоры, их основным назначением являлось усиление противолодочной обороны.

К началу 1944 г. противник имел на Черном море 14 подводных лодок — шесть германских, пять итальянских и три румынских. Фактически на наших коммуникациях действовали лишь германские и две румынские подлодки. Всего за период с 1 января по 10 сентября 1944 г. подводные лодки противника обнаруживались 223 раза. Больше всего (106 раз) это происходило в районе Потийской ВМБ, 50 раз — в районе Туапсинской ВМБ, 34 раза — на подходах к Новороссийской ВМБ, 11 раз — в районе освобожденного нашими войсками Севастополя, 7 раз — в операционной зоне Одесской ВМБ. По всему видно, что часть этих обнаружений оказались ложными.

В 1944 г., до окончания военных действий на Черном море, германские подводные лодки выполнили порядка 25 торпедных атак, румынские — ни одной. При этом немцы пять раз применяли акустические самонаводящиеся торпеды Т-5. В результате всех этих атак в 1944 г. мы потеряли 16 января танкер «Вайян-Кутюрье» (7602 брт); 12 мая — малый охотник СКА-0376; 29 мая — буксир «Смелый»; 19 июня — пассажирский пароход «Пестель» (1850 брт); 27 июня — баржу; 2 сентября — тральщик Т-410. Кроме этого торпедами повреждены: 11 мая — сторожевой корабль «Шторм» и 1 сентября — румынский транспорт «Oituz» (2686 брт).

Использовали германские подлодки и свой 20-мм зенитный автомат, а также не боялись идти на таран. В частности, U-20 24 июня артиллерийским огнем и таранным ударом потопила десантный бот ДБ-26; U-23 5 апреля из зенитного автомата повредила малый охотник СКА-55, a U-24 27 мая — парусно-моторную шхуну МШ-14.

Побочным эффектом деятельности германских подводных лодок нужно признать падение уровня боевой подготовки кораблей эскадры ЧФ и советских подлодок. Ведь главной причиной отсутствия полноценной отработки кораблями учебных задач являлось то, что ОВР не мог обеспечить их противолодочную оборону за пределами внутренних рейдов. Черноморские силы ПЛО имели в своем распоряжении силы и средства образца начала Второй мировой войны. Это делало их в значительной мере беспомощными даже против далеко не самых совершенных подлодок, которыми располагала Германия на театре.

Действия подводных лодок противника вызвали постоянный рост напряжения сил и средств противолодочной обороны. В период подготовки и проведения Крымской операции ПЛО стала для Черноморского флота одной из важных задач, решавшихся им в порядке повседневной боевой деятельности. На флоте систематически увеличивалось число катеров — малых охотников за подводными лодками. К началу 1944 г. их было 82 единицы, а в сентябре — уже 126 единиц, включая два дивизиона больших охотников по шесть кораблей в каждом. Пополнение шло за счет переброски с других театров по железной дороге. Первые пять больших охотников доставили в Ейск в июне 1944 г., но в реальных боевых действиях они поучаствовать уже не успели.