15 апреля 1944 года генерал-лейтенант Шерер получил совсем не престижный пост – инспектора береговой обороны войск рейхскомиссариата «Остланд» (территория Эстонии, Латвии, Литвы, центральной Белоруссии). Здесь он сменил генерал-майора Ульриха Шмидта, отправленного командовать Орт-комендатурой 679. В ведении Шерера находились войска береговой обороны от Нарвы до Либавы. Он занимался подготовкой противодесантной обороны, противодиверсионными и контрразведывательными действиями, а также участвовал в антиповстанческих акциях. С развертыванием наступления советских войск против группы армий «Север» тыловая береговая линия приобретала для фронта все большую значимость. При этом инспектор береговой обороны Шерер не сработался с командующим группой армий «Север» Шернером, прибывшим командовать 25 июля 1944 года. На почве личной неприязни 10 августа 1944 года Шернер добился ликвидации поста инспектора береговой обороны войск рейхскомиссариата «Север» и отставки Шерера ввиду «…невозможности использовать самого Шерера и его штаба в моем секторе». Генерал-лейтенант Теодор Шерер был выведен в резерв и долгое время не участвовал в войне.

В 1945 году ситуация для Рейха стала критической, и германское командование стало искать верных курсу высших офицеров, способных организовать и возглавить сопротивление малыми силами. Среди прочих Шерер подходил на эту роль. Вспомнились и Холм, и Великие Луки, и Велиж, и Новосокольники. 10 апреля 1945 года при формировании 48-го танкового корпуса он был назначен старшим офицером штаба 4-й танковой армии и руководил кампфгруппой в районе Лейпциг – Заале. Первоначально его кампфгруппа действовала против передовых американских войск и принесла янки немало проблем. Но 25 апреля американские авангарды вышли на Эльбу, а советские войска замкнули окружение Берлина. В этой ситуации командующий 48-м танковым корпусом генерал Эдельсхейм поворачивает войска на прорыв в сторону Берлина. В течение недели группа Шерера ведет бои с советскими войсками западнее Берлина, постепенно отходя за Эльбу. В мае 1945 года Теодор Шерер руководил обороной южного сектора Эльбы 48-го танкового корпуса генерала Эдельсхейма. 7 мая генерал-лейтенант Шерер сложил оружие и сдался американцам.

Арестован он не был.

В ходе войны Теодор Шерер проявил себя как исключительно храбрый, стойкий, уверенный в себе командир. Эти свойства были крайне важны, когда ситуация находилась на грани краха, когда нужно было просто упорно стоять в обороне, невзирая на окружающую обстановку. Однако при управлении войсками, в маневренной войне, при мобильной обороне или в наступлении Шерер не проявил талантов военачальника. Тем не менее он был одним из тех, кому вермахт обязан своими первоначальными успехами. С таким серьезным противником пришлось столкнуться советским командирам в начале 1942 года.

Теодор Шерер погиб в автокатастрофе в Людвигсбурге 17 мая 1951 года.

адн – артиллерийский дивизион

азп – автоматические зенитные пушки

АИР – артиллерийская инструментальная разведка

апп – авиаполевой полк

а/м – автомашины

ап – артиллерийский полк

БА – бронеавтомобили

бат ПВО – батарея противовоздушной обороны

бсв – батальон связи

бсн – батальон снабжения

всу – взвод связи и управления

гв. – гвардейский

ДЗОТ – деревянно-земляная огневая точка

дншо – дивизион штурмовых орудий

зап – зенитный артиллерийский полк

ЗСУ – зенитная самоходная установка

ЗУ – зенитная установка

иап – истребительный авиационный полк

инжб – инженерный батальон

иптап – истребительно-противотанковый полк

иптдн – истребительно-противотанковый дивизион

кап – корпусной артиллерийский полк

комр – комендантская рота

лдн – легкий дивизион

минп – минометный полк

мот. – моторизованный

мсбр – мотострелковая бригада

мск – мостостроительная колонна

мсп – мотострелковый полк

мтц – мотоциклы

оапсв – отдельный армейский полк связи

оатр – отдельная авторота

обсв – отдельный батальон связи

ов ПВО – отдельный взвод ПВО

огвминд – отдельный гвардейский минометный дивизион

огн. – огнеметы

озабат – отдельная зенитно-артиллерийская батарея

озадн – отдельный зенитно-артиллерийский дивизион

оиптадн – отдельный истребительно-противотанковый дивизион

олб – отдельный лыжный батальон

оминб – отдельный минометный батальон

оминбат – отдельная минометная батарея

оминд – отдельный минометный дивизион

омсб – отдельный медико-санитарный батальон

омср – отдельная медико-санитарная рота

омсрр – отдельная мотострелковая разведывательная рота

орподв – отдельная рота подвоза

орр – отдельная разведрота

осапб – отдельный саперный батальон

осапр – отдельная саперная рота

осб – отдельный стрелковый батальон

осв ОО – отдельный стрелковый взвод особого отдела

отб – отдельный танковый батальон

ПВО – противовоздушная оборона

пд – пехотная дивизия

пп – пехотный полк

ПТО – противотанковая оборона

птп – противотанковая пушка

ПТР – противотанковые ружья

рб – разведывательный батальон

РГК – резерв главного командования

рполб – резервный полицейский батальон

рПТР – рота противотанковых ружей

РС – реактивные снаряды

рто – рота технического обеспечения

рхз – рота химзащиты

сбр – стрелковая бригада

сд – стрелковая дивизия

ск – стрелковый корпус

сп – стрелковый полк

стрб – строительный батальон

сэ – самокатный эскадрон

тбр – танковая бригада

тп – танковый полк

тр – трактора

тяг. – тягачи

учсапб – учебный саперный батальон