26 октября — освящение Иверской часовни на Красной площади Москвы.

4 декабря — на III Всемирном Русском Народном Соборе Патриарх Алексий критикует политику властей в России.

1996, февраль — начало враждебной политики Константинопольского Патриарха Варфоломея по отношению к Московскому Патриархату. Апрель — участие в торжествах, посвящённых возвращению Церкви Александро-Невской лавры в Санкт-Петербурге.

14 апреля — первая пасхальная вечерня под сводами храма Христа Спасителя.

Май — накануне президентских выборов Патриарх Алексий выступает с критикой дел президента Ельцина.

Июль — посещение возрождающихся Валаама и Оптиной пустыни.

Осень — первосвятительский визит в Среднюю Азию.

Вторая половина декабря — тяжёлая болезнь Патриарха Алексия.

1997, конец февраля — Патриарх проводит очередной Архиерейский Собор. Объявлено об издании многотомных «Истории Русской Церкви» и «Православной энциклопедии». Заявлен курс на размежевание с мировым экуменическим движением. Анафема бывшему митрополиту Филарету (Денисенко) за его раскольническую деятельность на Украине.

5 мая — резкая критика политики властей в России Патриархом на IV Всемирном Русском Народном Соборе.

Июнь — паломничество Патриарха Алексия на Святую землю, празднование 150-летия Русской духовной миссии в Иерусалиме.

Конец июня — визит в Австрию. Разногласия с президентом Ельциным, отклонившим закон «О свободе совести и о религиозных объединениях».

Июль—август—сентябрь — поездки в Прибалтику, Ярославскую епархию, Одессу; переговоры с Константинопольским Патриархом Варфоломеем.

Сентябрь — под давлением Патриарха Ельцин подписал закон «О свободе совести и о религиозных объединениях».

1998, весна — резкая критика Патриархом Алексием ситуации в стране. Разногласия с Ельциным по поводу принадлежности останков, найденных под Екатеринбургом.

Август — посещение Валаама и Саввино-Сторожевского монастыря.

Сентябрь — визит в Белоруссию.

Октябрь — посещение Оптиной пустыни.

Ноябрь — визит в Воронежскую и Липецкую епархии.

1999, 19 февраля — награждение Патриарха Алексия орденом Андрея Первозванного.

23 февраля — семидесятилетний юбилей Святейшего Патриарха Алексия II.

11 марта — заявление Патриарха с призывом положить конец преступной деятельности чеченских бандитов, наладивших целую индустрию работорговли на Северном Кавказе.

20—22 апреля — Святейший Патриарх находится в блокадном и обстреливаемом Белграде.

Май — канонизация праведной Матроны Московской; визит Патриарха Алексия в Японию.

22 июня — заявление Патриарха по поводу неприятия им независимости Косова.

Июль — паломничество на Валаам.

Осень — ряд поездок Патриарха по многим епархиям России.

12 ноября — заявление Патриарха о том, что Церковь поддерживает контртеррористические операции на Северном Кавказе.

Декабрь — поездка в Восточную Сибирь и работа V Всемирного Русского Народного Собора.

2000, январь — паломничество Патриарха Алексия на Святую землю.

7 мая — впервые после 1917 года нового главу государства — президента России В. В. Путина — перед вступлением в должность благословил Предстоятель Русской Православной Церкви, и впервые после 1682 года — Патриарх Московский и всея Руси.

10—12 мая — поездка Святейшего на Дальний Восток.

13—18 мая — поездка в Японию.

10 июня — десятилетие интронизации Патриарха Алексия.

Июль — поездка на Валаам.

Август — Архиерейский Собор, на котором Предстоятель выступил с фундаментальным докладом о деятельности Церкви в минувшем столетии.

Осень — поездка на Урал.

2001, лето — поездки Патриарха по Поволжью, в Чувашию, Мордовию, канонизация адмирала Фёдора Ушакова в лике святых. Посещение Западной Сибири.

20—22 августа — паломничество на Соловки вместе с В. В. Путиным.

3 сентября — сорокалетие архиерейского служения. Патриарх Алексий выступил с осуждением действий террористов после событий 11 сентября в Нью-Йорке.

Октябрь — смена руководства Русской Зарубежной Церкви, начало медленного её сближения с Русской Православной Церковью Московского Патриархата.

13 декабря — появление В. В. Путина на VI Всемирном Русском Народном Соборе.

2002 — экспансия Ватикана в России, вызвавшая решительные протесты Патриарха Алексия.

14 марта — окончание строительства храма Христа Спасителя.

Май — визит в Белоруссию.

7 июня — начало постоянного сотрудничества с Высшим религиозным советом народов Кавказа и лично Патриарха Алексия с председателем Управления мусульман Азербайджана и Кавказа Шейх-уль-исламом Аллахшукюром Паша-заде.

Июнь—июль—август — пастырские визиты в Рязанскую епархию, в Санкт-Петербург, на Валаам, в Тамбовскую и Костромскую епархии. Конец октября — посещение Астраханской епархии, резкое ухудшение состояния здоровья. До конца года Святейший Патриарх находится на излечении.

2003, 26 марта — открытое письмо Патриарха Московского и всея Руси Генеральному секретарю ООН с осуждением агрессии США против Ирака.

Июль—август — торжества в Сарове по поводу столетия прославления преподобного Серафима Саровского.

Сентябрь — посещение Эстонии.

Ноябрь—декабрь — первый обмен официальными делегациями с Русской Зарубежной Церковью. Создание комиссии по обсуждению вопросов, касающихся восстановления канонического общения двух Церквей.

2004 — 75-летие Патриарха Московского и всея Руси Алексия II.

3 февраля — в Свято-Троицкой Сергиевой лавре на открытии VIII Всемирного Русского Народного Собора Патриарх провозгласил, что настала пора заново осмыслить значительную роль Православия в мировой истории, в начертании судьбы человечества.

23 февраля — Святейший награждён орденом «За заслуги перед Отечеством» 1-й степени.

Май — официальный визит в Россию Предстоятеля Русской Зарубежной Церкви митрополита Лавра.

9 июня — перенесение мощей святителя Филарета (Дроздова) в храм Христа Спасителя.

2005, январь — по инициативе Патриарха Алексия начал работу православный кинофестиваль «Лучезарный Ангел».

Май — участие в праздновании шестидесятилетия Победы.

Июль — посещение Татарстана, Владимирской и Ярославской епархий.

Август — поездка в Калужскую епархию, в Санкт-Петербург и на Валаам.

Сентябрь — визит в Азербайджан, посещение Тульской епархии и участие в торжествах по случаю 625-летия Куликовской битвы.

Ноябрь — поездки в Нижегородскую епархию « в Молдавию.

2006, февраль — под руководством Патриарха Алексия на X Всемирном Русском Народном Соборе выработана и провозглашена «Декларация о правах и достоинстве человека».

Май — достигнуты договорённости о грядущем восстановлении канонического общения с Русской Зарубежной Церковью; Святейший посетил Латвию.

3