Между тем французская армия в Испании, потерпев поражение в сражении при Витории (21 июня 1813 года), была вынужден очистить почти весь Пиренейский полуостров, за исключением Каталонии. Союзные войска под командованием Веллингтона угрожали вторжением во Францию с юга. В создавшейся на Пиренейском фронте критической обстановке Наполеон направляет туда Сульта в звании своего наместника с неограниченными полномочиями. Перед ним была поставлена задача во что бы то ни стало не допустить вторжения союзников во Францию через Пиренеи.

12 июля 1813 года Сульт прибыл из Дрездена в Байонну (Южная Франция) и сразу же развернул активную деятельность по выполнению указаний своего императора. Находившаяся в его распоряжении французская армия едва насчитывала 60 тыс. человек и состояла большей частью из новобранцев. Череда непрерывных поражений привела к ее деморализации, морально-боевой дух войск был основательно подорван, боеспособность вплотную приблизилась к критической черте, тыл и снабжение войск находились в запущенном состоянии. По существу, перед Сультом стояла задача восстановить разгромленную противником армию, вдохнуть в нее уверенность в своих силах и попытаться исправить то катастрофическое положение, в котором оказалась французская Испанская армия летом 1813 года.

Уже через 2 недели после своего прибытия в Испанскую армию Сульт перешел в наступление. Но союзники, обладавшие более чем двукратным превосходством в силах, отбили все атаки французов (сражение при Ронсевале и др.) и принудили их отступить. Столь же неудачна была и повторная попытка Сульта перейти в наступление в августе 1813 года. Потерпев поражение в сражении под Ируном, он вынужден был отступить на французскую территорию.

8 октября 1813 года союзные войска перешли пограничную реку Бидассоа и вторглись во Францию. Сульт мужественно и с большим искусством защищал каждую пядь французской земли, сражаясь против превосходящих сил противника (сражения на реке Нивель, при Байонне и др.). Но вынужденный постоянно отсылать к Наполеону свои лучшие полки и заменять их новобранцами, он с большим трудом сдерживал натиск врага. Так прошло несколько месяцев.

Кроме борьбы с внешним врагом, Сульту в этот период пришлось вести тяжелую борьбу с происками и частыми мятежами в своем тылу французских роялистов, которые резко активизировали свою подрывную деятельность после вторжения вражеских войск на территорию Франции. Серьезно осложняли организацию эффективной обороны ненастная погода и плохое тыловое обеспечение войск.

В середине февраля 1814 года внезапно ударили сильные морозы, многочисленные ручьи, речки и каналы замерзли. Веллингтон воспользовался этим и возобновил наступление. 27 февраля 1814 года Сульт был разбит в сражении при Ортезе, 1 марта — при Эре. Тогда он решил, пожертвовав Бордо, на который наступали союзники и который он до сих пор прикрывал, двинуться к Пиренеям, создать угрозу тылу противника и этим смелым, но рискованным маневром сорвать его дальнейшее продвижение в глубь Франции. Замысел Сульта в основном оправдался: 90-тысячная армия Веллингтона прекратила наступление на бордосском направлении и двинулась наперерез 40-тысячной армии Сульта. 10 апреля произошло сражение под Тулузой. В нем Сульт, хотя и был побежден, но покрыл себя славой. Через несколько дней, получив известие о падении Парижа и отречении Наполеона, он заключил перемирие с Веллингтоном.

С реставрацией Бурбонов Сульт, как и все остальные маршалы Наполеона, перешел на службу новому режиму. Король Людовик XVIII принял его милостиво: назначил командующим (военным губернатором) 13-го военного округа (Ренн), наградил командорским крестом ордена Св. Людовика, а в декабре 1814 года назначил военным министром. Однако эта высокая должность была в то время очень неблагодарная и крайне щекотливая. Дело в том, что действия Бурбонов и возвратившихся с ними во Францию многочисленных эмигрантов оскорбляли армию и народ, пришедшие к власти на иностранных штыках роялисты ненавидели Сульта и не доверяли ему. В их глазах новый военный министр был прежде всего враг, сражавшийся почти четверть века против них сначала под революционными знаменами, а затем — под императорскими орлами «узурпатора» Наполеона. После нескольких тщетных и даже унизительных попыток добиться расположения как роялистов, так и бонапартистов, Сульт подал в отставку, когда в марте 1815 года узнал о возвращении Наполеона с острова Эльбы. Получив ее, он удалился в свое поместье близ Сен-Клу.

Уже на 3-й день после своего триумфального вступления в Париж Наполеон вызвал Сульта к себе. 9 мая он был назначен начальником Главного штаба армии. Эту должность при Наполеоне почти 20 лет, начиная с Итальянского похода 1796—1797 годов, бессменно занимал маршал Л. Бертье. Одновременно Наполеон назначил Сульта также и членом палаты пэров. Сульт энергично взялся за выполнение своих новых обязанностей. Он проинспектировал войска и крепости на севере Франции, издал враждебные Бурбонам прокламации и развернул активную подготовку к предстоящей войне.

В кампании 1815 года Сульт являлся ближайшим помощником Наполеона, участвовал в сражениях при Линьи и Ватерлоо. Во время последнего из них, увидев, что его старый недруг (еще по Испании) маршал Ней повел конницу в атаку на англичан без поддержки пехоты, Сульт говорит Наполеону, не скрывая своего злорадства: «Ней снова компрометирует нас» (он имел в виду опрометчивые действия Нея в сражении под Йеной в 1806 году). Но император, только что узнавший о том, что Сульт направил к маршалу Груши с приказанием немедленно идти к полю сражения при Ватерлоо лишь одного офицера, тут же, не скрывая раздражения, осек своего начальника штаба: «Милостивый государь, Бертье направил бы не одного, а сто гонцов!» Тем самым он выразил свое негативное отношение к опрометчивым действиям самого Сульта. Тяжелое предчувствие не обмануло Наполеона: приказ Груши так и не был доставлен вовремя. А сам маршал оказался неспособным повторить подвиг Дезе при Маренго.

После катастрофы при Ватерлоо (18 июня 1815 года) Сульт принял в Лаоне (Лан) от Наполеона главное командование армией, но в Суассоне по требованию Временного правительства вынужден был сдать должность главнокомандующего маршалу Груши.

На заседании палаты народных представителей (парламент) он заявил о невозможности защищать Париж и последовал с армией за реку Луара.

После роспуска армии Сульт некоторое время вынужден был скрываться, но вскоре был арестован и брошен в тюрьму. Через 3 месяца освобожден и в январе 1816 года изгнан из Франции. Поселился в г. Дюссельдорфе (Германия), где написал мемуары.

В 1819 году Сульт был помилован и получил разрешение вернуться во Францию. Ему было возвращено маршальское звание. После этого Сульт проявил себя как ярый роялист. Выступал за принятие жестких мер против республиканцев.

Такое поведение Сульта было должным образом оценено Бурбонами. В 1825 году новый король Карл X наградил Сульта орденом Св. Духа, а в 1827 году возвратил ему звание пэра.

Революция 1830 года, завершившаяся свержением старшей линии Бурбонов и воцарением Орлеанской династии, открыла перед Сультом новое поприще, на этот раз политическое. Новый король Луи-Филипп сохранил за Сультом звание пэра Франции и назначил его военным министром (1830). Эту должность он занимал 4 года, активно занимаясь вопросами устройства армии, чем немало способствовал утверждению нового режима.